海崎新太（27岁）在作为新毕业生进入的公司工作了3个月就辞职了。 之后他的就职活动也不顺利。 双亲寄来的生活费也中断了，不得已只好回到乡下。 能够倾听他烦恼的朋友和女友全都没有…… 穷途末路的海崎面前出现了一位神秘人物·夜明了。 夜明向海崎提出，要他参加以尼特为对象的社会复归程序“ReLIFE”。 其内容是，利用神秘的秘药，仅仅让外表回复年轻，并在一年内以高中生的身份去读高中——。
在魔法的世界里，小魔女优优（諸星すみれ 配音）和妹妹宁宁（加隈亜衣 配音）共同经营着诅咒业务，她们每天在魔法的帮助下上天入地，为他人排忧解难，生活悠闲自在，无忧无虑。可就在某个平常的日子里，魔法世界突然出现前所未有的震动，城镇和森林仿佛被某个淘气的孩子用胶水和泥巴杂乱无 章地捏在了一起。优优趋前调查，结果竟意外地来到了另一个世界。在那里她的身形意外变大，好像比实际年龄长了几岁，她遇到了丢失父母的少年孝洋（泽城美雪 配音）一家，得知这是一个没有魔法的世界。为了找到返回魔法世界的办法，并找到孝洋的父母，优优和另一边的姐姐合作，踏上未知的征程…… 本片根据漫画《のろい屋しまい》改编。
本作是以解谜为题材的原创动画，Phi-Brain是指拥有黄金比大脑之人，而主人公Kaito作为Phi-Brain的候补者之一，为解开传说中的“神之谜题”而展开一场冒险。 热爱解谜的私立√（Root）学园高一学生大門Kaito，在偶然的机遇下挑战了潜藏在学园近郊地下遗迹中的“不可解之谜”，那是由神秘的智囊集团POG所制造的、招致生命危险的“贤者之谜”。被真相激怒的Kaito漂亮地攻克了贤者之谜，意外地从中获得了“Solver(解答者)”的指名。于是Kaito与青梅竹马的少女Nonoha以及其他拥有解答者身份的同伴们一起，以存在于世界各地的“贤者之谜”为舞台，与POG展开解谜对决。
故事描述女主角小樱（木之本樱）与男朋友小狼（李小狼）和其他同学从小学毕业后升上初中的故事。 在一次小樱做梦梦到53张樱之卡上面的图案都消失了，一名神秘人物出现之后库洛牌都碎掉了， 小樱从这个梦醒来翻开封印之书发现库洛牌都变成透明的了! 在与知世、小狼和艾力欧的讨论下，小樱重新踏上了收集透明牌的故事。
“只有学得上级魔法才能独当一面。爆裂魔法之流不过是搞笑魔法罢了”与红魔族之里的这一教训背道而驰，惠惠为了学得爆裂魔法而努力向学，并几乎每天都被同班同学的悠悠发起挑战，过着匆匆忙忙的学校生活。在这样的某一天，她一回家就发现妹妹小米抱着一只不认识的黑猫——！？
15世纪的欧洲某国。在跳级中被允许进入大学的神童拉法尔。他回应了周围的期待，宣布将专攻当时最重要的神学。但是，从以前开始就热心投入的对天文的热情一直没有被抛弃。 有一天，他遇到了一位名叫休伯特的神秘学者。因为触犯了基于异端思想的禁忌而受到拷问，被关进监狱的休伯特。 他研究的是关于宇宙的冲击性的“某个假说”——。
小五郎应京都寺院的邀请，前往京都调查寺内八年前佛像盗窃事件。寺院早前得到佛像下落的线索，是一件有不同图案的图画，提供给小五郎，以便尽快寻回佛像。同时间，东京、大阪和京都发生杀人事件，三个城市的警方调查后，发现事件中的死者都是盗贼团“源氏萤”的成员，毎人都有一个代名，以《义经》内的传统人物命名。 服部亦因此事，前往京都调查杀人事件的真相。期间遇上柯南，两人一起调查两宗事件，发现两宗事件都有共同点，有助解开八年前佛像盗窃事件。在调查期间亦发生杀人案，服部因此而受袭，和叶亦因查找施袭者线索而被人挟持。
来自英国、中国、美国等五个国家的六个孩子来到了小丸子（Tarako 配音）的家乡清水市。来自意大利的安德烈（中川大志 Taishi Nakagawa 配音）暂住在了小丸子的家里。小丸子他们和外国小朋友们一起在学校里上课，还利用周末一起前往大阪和京都去旅行。一开始，小丸子因安德烈太过热情而感到困扰，但是知道了他来日本的理由后便开始和他和睦相处了。他们俩一起去逛了庙会，并许下了“希望能再次见面”的愿望。然而，这些快乐的日子即将过去，他们将要迎来离别之时。
