一直都过得很平凡，不管是运动还是读书都差强人意，绝对无法成为第一名的普通人——斋藤，被召唤到了异世界。即使在异世界，斋藤也绝非是特别的，一点都不强。但在与超有个性的伙伴一起挑战攻略迷宫的过程中，告诉严重健忘的魔法师咒语、用身体当盾来保护小妖精、将针对敌人的合适武器拿给战士，他逐渐成为了队伍当中不可或缺的存在。
幕末の動乱期、"人斬り抜刀斎"と恐れられた志士がいた。その男は、新しい時代の到来と共に人々の前から姿を消し去り、「最強」という名の伝説と化していった。 時は流れ――明治十一年、東京下町。逆刃刀を腰に下げ、不殺を誓う旅の剣客・緋村剣心は、神谷活心流の師範代・神谷薫と出会う。剣心は、活心流を騙る辻斬り「人斬り抜刀斎」の事件を解決したことをきっかけに、薫のもとに居候することとなる。東京府士族出身の明神弥彦、喧嘩屋を称する相楽左之助といった仲間たちとの出会い過去の因縁によって戦うこととなる宿敵たちとの対峙。新しい時代を懸命に生きる人々による明治剣客浪漫譚、ここに開幕――！
少女宫下藤花，当她察觉到“世界之敌”的时候便会诞生出另一个名为“不吉波普”的人格。围绕着各种奇怪的事件，少年与少女们的故事慢慢展开了——
日升X桂正和黄金班底制作！回溯到《老虎&兔子》100年前…大都市“里斯维尔特”的不法犯罪中，与“圣歌”这一迷之物质相关的案件正在上升。圣歌能唤醒异常的行动力与身体变异，是一种很难对付的物质。为了应对圣歌犯罪，成立了特殊警察组织『SEVEN -O』。个性鲜明的各种人物相互交织，一部新感觉科幻刑警动画就此诞生！！
故事以前作《科学小飞侠Crowds》的后续剧情展开。距离“立川事件”已经过了一年，当初贝尔库·卡切赋予尔乃美家累的力量“CROWDS”在日本首相菅山的推广之下已在人类社会当中广泛普及。然而仍然存在着对此感到不满的人们，此时菅山遭到不明人士的袭击，GATCHAMAN的全新战斗就此揭开序幕。
从小便能看见妖怪的少年夏目贵志。自从他从祖母玲子那里继承了与妖怪成为主从并将其名字书写在上的契约书“友人帐”以来，便与自称为保镖的妖怪猫咪老师一同，开始了将名字返还给妖怪的每一天。夏目与各种各样的妖怪与善良人们相遇，在构筑温暖的场所同时，也反复寄托着想要守护重要之物的想法。
