在2016年电影的事后，弗兰克、布伦达、巴瑞和萨米试图建立自己的食物社会。
都立日野南高校に通う女子高生、虎視こし虎子とらこ。 ある日の登校中、 彼女は顔に冷たいものが当たるのを感じた。 ふと上を見ると、そこには鼻水をたらし、 ツノが電線に引っかかって 身動きが取れなくなっている女の子が――！？ うっかり変な『ツノ』の生えた 少女・鹿乃子しかのこのこを助けたことで、 優等生（の皮を被った）虎視虎子の人生が かき乱されていく…… 一人の少女（元ヤン）が一人のシカ（？）に出会う ガール・ミーツ・シカ物語開幕！！
《咕噜咕噜魔法阵》讲述了一个这样的故事：在吉姆吉姆大陆上的一个小村庄吉米拉村，有一天，国王颁布了勇者召集令悬赏，如果有人能够消灭魔王将会得到五万R并且能够成为哥达国的王子。仁杰的父亲发现了召集令，为此训练他的儿子、强迫儿子成为勇者踏上旅程。吉米拉村有着旅行前不得不去拜访 魔法婆婆的规则，按照这个规则，仁杰到达了魔法婆婆的家，勇者被命令和能够使用咕噜咕噜魔法的米古米古族人歌莉一起踏上旅程。然后被国王认同是勇者的仁杰以打倒企图征服世界的魔王纪力而和歌莉开始了旅程。
小五郎应京都寺院的邀请，前往京都调查寺内八年前佛像盗窃事件。寺院早前得到佛像下落的线索，是一件有不同图案的图画，提供给小五郎，以便尽快寻回佛像。同时间，东京、大阪和京都发生杀人事件，三个城市的警方调查后，发现事件中的死者都是盗贼团“源氏萤”的成员，毎人都有一个代名，以《义经》内的传统人物命名。 服部亦因此事，前往京都调查杀人事件的真相。期间遇上柯南，两人一起调查两宗事件，发现两宗事件都有共同点，有助解开八年前佛像盗窃事件。在调查期间亦发生杀人案，服部因此而受袭，和叶亦因查找施袭者线索而被人挟持。
