1989年，日本。 乔纳森·乔斯达与DIO决战后的一百年，DIO复活了。同时，乔瑟夫的孙子，空条承太郎发现自己有幽波纹（替身）能力，DIO的复活影响了没有替身抵抗能力的母亲，陷入病危情况；为了拯救命在旦夕的母亲，承太郎与乔瑟夫出发前往DIO的所在地——埃及。
本作品的出场人物，大部份取自格林童话里的人物。这些人物在本作中，作了大幅度的整理，让每一个童话人物一看就知道是哪一个人物。 故事的男主角铃风草太，是一个中学生。一直以来，他都很想探求小时候母亲说过的一个童话故事。有一天，草太在耳边隐约听到一把神秘的声音，正在说着这故事的内容。他这把声音引诱到秋叶原的小巷中。草太就是这样，遇到一个称他为“艾尔岱之钥”的男人。这男人突然变身为恶梦魔，对草太施以袭击。在电光火石间，一只会说话的狼救了草太，并与一个戴着红色头盔的神秘少女会合，把恶梦魔击退。这个少女，就是四叶骑士团成员、三枪士之一——小红帽。小红帽从魔法世界范达威利，来到现实世界艾尔岱，目的就是要保护草太，以免他落入企图侵略艾尔岱世界的邪恶魔女桑德利永手中。他们在范达威利经历了很多冒险，最后由三枪士、威尔、哈梅林、汉泽尔兄妹，化成七贤者，再次封印桑德利永。
