每当黑暗污染这片大地时，一群正义勇敢的少年便会挺身而出，他们环绕在雅典娜的周围，与世间邪恶展开殊死搏斗。一代又一代，雅典娜的圣斗士们从未退却。当星矢、紫龙等圣斗士经历了无数的磨难与考验后，新一代的圣斗士也相继成长起来。他们分别是天马星座光牙（绿川光 配音）、幼狮星座苍摩（小西克幸 配音）、天鹰星座尤娜（雪野五月 配音）、天龙星座龙峰（柿原彻也 配音）、豺狼星座荣斗（柿原彻也 配音）等人。与此同时，蕴藏着黑暗小宇宙的邪恶战神玛尔斯（柴田秀胜 配音）率领斗士火星士向和平的大地逼近。圣斗士的内战再次掀起，而正义的战士们也面临着新的挑战…… 本片依据日本著名漫画家车田正美的经典原著改编
冈田猛男（江口拓也 配音）是集英高中一年级的学生，隶属于柔道部，他生得人高马大五大三粗，却因为善良率真的个性而深得同伴们的喜爱和信赖。砂川诚（岛崎信长 配音）是猛男青梅竹马的好友，外表英俊帅气的他很受女孩子的欢迎，从小到大，凡是猛男喜欢上的女孩，最后总会被阿诚吸引，久而久之，猛男竟然也习以为常。 一次偶然中，猛男将一位名叫大和凛子（潘惠美 配音）的可爱女孩从电车痴汉手中救下，温柔可爱的凛子一下子击中了猛男的死穴，但猛男认为凛子喜欢的应该是阿诚那样的类型。让猛男没有想到的是，凛子喜欢的竟然正是强壮的猛男，阿诚得知了凛子的心意后开始积极地在两人之间牵线搭桥起来。
阳光明媚的一天，碧海蓝天，海鸥飞翔，在一座植被茂密的小岛上，漩涡鸣人、佐助、小樱以及井野、志乃登一众下忍没有任何修炼任务，而是悠哉游哉地坐在海边举行烧烤聚会，只不过这群性格别扭的家伙却分坐在不同地方，各自为政。超级贪吃的漩涡鸣人意外在沙滩下发现一支普普通通、破破烂烂的瓶子，他随手打开瓶盖，却从里面喷出一股浓郁的烟雾。烟雾散去，一个身形巨大的怪大叔出现，他就是传说中的壶中魔神，可以满足人们三个愿望。 鸣人他们起初并不相信魔伸的说法，但在见识了对方的法力之后，却不由得佩服起来。可惜他们有意无意浪费了两个愿望，而今只剩下最后一个，各怀私心的下忍们在岛上展开了一场激烈的争夺战……
故事发生在平安时代中期，疾病和灾荒令原本的政府逐渐没落，如今是武士与阴阳师的天下，而这两方势力为了争夺完全的统治权而展开着无休无止的争斗。为了拯救百姓与水火之中，政府命令源赖光（三木真一郎 配音）出发寻找可以为人们带来幸福的勾玉，可是在出发至极，源赖光却卧病不起，无奈之中，只得由他的妹妹源光（水泽史绘 配音）女扮男装替兄出征。 在忠心耿耿的家臣渡边纲（三宅健太 配音）的护送下，源光踏上了旅程。一路上，她结识了许多身怀绝技的旅伴。吟游乐师万岁乐（三木真一郎 配音）和年岁过百的阴阳师安倍晴明（德丸完 配音）成为了源光寻找勾玉的得力助手，然而，就在勾玉的下落渐有眉目的时候，源光却从源赖光处得到了安培晴明想要毁灭京都的噩耗。一边是兄长，一边是生死与共的同伴，源光究竟应该相信谁？
