我的妹妹哪有这么可爱第二季

本作是以解谜为题材的原创动画，Phi-Brain是指拥有黄金比大脑之人，而主人公Kaito作为Phi-Brain的候补者之一，为解开传说中的“神之谜题”而展开一场冒险。 热爱解谜的私立√（Root）学园高一学生大門Kaito，在偶然的机遇下挑战了潜藏在学园近郊地下遗迹中的“不可解之谜”，那是由神秘的智囊集团POG所制造的、招致生命危险的“贤者之谜”。被真相激怒的Kaito漂亮地攻克了贤者之谜，意外地从中获得了“Solver(解答者)”的指名。于是Kaito与青梅竹马的少女Nonoha以及其他拥有解答者身份的同伴们一起，以存在于世界各地的“贤者之谜”为舞台，与POG展开解谜对决。

舞台是名门金伯利魔法学校。在这所学校，毕业前有两成学生或残废或失踪，还有人发狂并最终死去。这就是所谓的“为魔所噬”——春天，奥利佛·霍恩来到了金伯利。他温和而理性，背后却有着若隐若现的阴影。他身边聚集起出身背景各不相同的少年少女，并与魔法师们尽可能地互相切磋。这些未来的魔法师们满怀希望地走过了学园的大门。然而，人称魔境的金伯利却对他们露出了危险的獠牙。与伙伴们邂逅，前往魔境的他将面临什么样的命运――于是，围绕“七魔剑”展开的故事，现在，开始了。

大阪的地标日卖电视台突发爆炸事件！ 那时，里面正在录制“皋月杯”百人一首和歌赛记者会，而突发事件让全场陷入恐慌！ 轰然倒塌的大楼里，唯有西部名侦探服部平次和他的青梅竹马远山和叶被困其中，但在千钧一发之际，柯南将两人救出。 在这如同恐怖行动的事件中，众人既不知道犯人所图为何，犯人也没有主动发表声明，这让柯南与平次非常不解。 混乱之中，柯南一行人遇见了自称是“平次未婚妻”的女性。她的名字是大冈红叶。她说自己是【在小时候就向平次求过婚的命中注定之人】。而且，她还是赢得百人一首和歌赛的高中生组冠军，被称作“未来的女皇”。 与此同时，在京都岚山的日式住宅内，皋月杯的获胜选手惨遭杀害。而那时现场的监视器上显示出来的竟是红叶的身影。在那里，某首“歌谣”正在低沉地萦绕——

　　曾经，世界面临着被称为「邪龙」的邪恶存在所毁灭。
　　然而，一个勇者打败了邪龙，拯救了世界。 此后，已经过了将近200年的时间。
　　在众多的迷宫都市之一的马萨特，住着一个被称为「无能」的男人。 他叫劳斯特，职业是治愈师。 由于他的无能，劳斯特受到其他冒险者的蔑视、利用和抛弃。 他的日子就是这样日复一日的重复着。
　　某一天，一个少女出现在了劳斯特的面前。 她叫纳尔赛娜，职业是武道家。 纳尔赛娜对刚刚被队伍驱逐的劳斯特说： “哥哥，你愿意和我组队吗？”
　　如今，劳斯特和纳尔赛娜，两个人的冒险开始了。

　　自古以来，生灵万物自出生时就带来了两股能量——幸福的能量和不幸的能量。然而日本的佛女津市这两股能量的平衡却遭到了破坏。神明界掌管幸运与不幸平衡的穷神会派出穷神红叶（内山夕实 饰）下凡到人间调查破坏运气秩序的元凶樱市子（花泽香菜 饰）。16岁的高中生樱市子是一名集美丽、智慧、财力、运动细胞于一身的天生幸运儿，她从出生就不知道什么是努力和失败。红叶用观察幸福与不幸能量值的眼镜看出原来樱市子不仅幸福的能量值大大高于常人，还在不断汲取着别人的幸福能量。红叶断言如果樱市子继续不断吸收别人的幸福能量的话，将会招致身边人变得不幸。于是红叶宣布要废掉樱市子吸收幸福能量的能力并且把她多得离谱的幸福能量还回它们应有的地方……

　　知名舞台剧女演员牧树里这日收到怪盗基德的预告信：在26个字母的盘旋飞舞中，他来拜领无价的“命运的宝石”。毛利小五郎受到牧树里委托将信件分析，认为基德将在演出最后一晚前来盗取宝石，当晚他及柯南、小兰等人来到剧场，那里早有诸多警察守候。
　　令柯南吃惊的是，基德竟扮成工藤新一出现在众人面前，但他及众人方向不同的紧张过后，宝石并没被盗，柯南醒悟字母预告信与航班相关。而柯南、小兰、牧树里及其同事搭乘的前往北海道的飞机上，尚有一起杀人计划正被精心设计。