在科技发达的未来，网络上流传着一种真假不明、被称为“全息幽灵”的奇怪现象。初中一年级的天之河宙因为启动了父亲留下的被称为“数码暴龙机”的神秘设备，开始能看到大家看不见的未知生物“数码宝贝”。父亲将一只顽皮的数码宝贝“伽马兽”托付给宙，自那天起，宙便被卷入了各种奇怪的事件之中……
2016年，由于开始侵蚀世界的怪人“BugStar”=未知的电脑游戏病毒侵蚀开始。为了救助感染者，决定与BugStar战斗的天才玩家宝生永梦变身为假面骑士Ex-Aid。
天生拥有一头如红频果般美丽发色的少女，白雪，因为这样的稀有发色而被恶名昭彰的拉冀王子看上，打算强行纳她为爱妾。感到困扰的白雪决定离开自己的国家，并在邻国克拉利涅斯的森林之中，遇到了一名少年，千。 在与千成了朋友，且与拉冀王子有关的问题也解决后，白雪决定在克拉利涅斯王国留下来，朝自己的目标努力着......
