家族败落，至亲受难，罗征从云端跌落成为一名卑微家奴，在各族抗争不断、神秘力量统治的世界，不甘堕落的罗征偶得神秘功法，炼自身为器，一道抗争的序幕，就此轰然拉开。
基因石被毁，不料基因石能量逸出，飘散到地球各处，引发了异常现象，故事从变形机甲、机甲兽和变异战士三方之间的斗争展开。
性格机灵的初中生英男偶然得到一枚星环，并从中得到神奇的力量，借星环之威表现出超人的能量。发现星环神奇能力的英男和同学们一起开始探索星环的奥秘。英男等人在探索过程中发现星环不仅使自己变得强大，更能发挥出不同的特殊技能，同时他们还发现了奥加要毁灭地球的计划，英男决定接受命运的挑战，担负起保护地球的重任，成为真正的守护者。
虽然危机当前，但英雄团之间的情谊也更上一个台阶，配合也愈发默契。经历了彪汉的失利，猪猪侠帮助它重拾了对力量的掌控。经历了私语之海的挑拨，英雄团更明白了坦诚的重要性。他们相互救助、互相信任，逐渐成为一只最棒的团队。最好的预言英雄，每一次的挫折只会让他们之间情感的纽带愈加坚固。 当然，光靠自己的力量是不够的，英雄团们在搜寻海心碎片的过程中，也结识了不少人物 有沧龙、虾人族……他们有的一开始是敌人，有的是受到帮助后报答的海兽。他们的立场也随着剧情的变化而变化，英雄团也会陷入拯救眼前居民和搜寻碎片之间的矛盾。但英雄团拯救家园的真心还在，朋友就会越来越多。 当年的聂墨西斯大王死灰复燃，给猪猪侠团队制造了各种危险麻烦，但是主角团队并没有因此而退缩，反而迎难而上，在困难中不断成长。逐渐加深的团队默契和保卫家园的信念让他们坚信自己是可以拯救世界的英雄。冒险小队与珊瑚公主等一批正义之士并肩作战，挫败了聂墨西斯一系列阴谋诡计，接下来的任务将更加艰巨，但他们依然勇往直前，永不言弃。
在本季《超级飞侠12》中，超级飞侠依然会接收来自世界各地小朋友的电话，为小朋友定制他们需要的特别的东西，并将东西送到他们手上。当小朋友们遇到困难，乐迪会请求总部的帮助，超级飞侠将带来拥有各种属性的愿望能量球，和小朋友们一起摇身一变成为酷炫的愿望守护者，陪同小朋友一起解决问题。而上一季新登场的三位超级飞侠新成员：恐龙飞机超级飞侠大壮、速食卡车超级飞侠糯糯、高速火车超级飞侠咚咚，也会在这一季中展示他们的过人之处。而当困难升级，超级基地也会变成超级机器人，跟超级飞侠一起陪小朋友们度过难关。
