神奇阿呦第二部全集故事讲述的是在神奇阿呦第一季最后一集中阿呦为了给小米去掉颜料，前往别的星球，机器流星人利用阿呦的善心逃脱，却引来了一个真正的流星人阿巴。阿呦把流星人阿巴带回小米家，但小米嫌它吵，阿巴就跑出去了。阿巴觉得实现别人的愿望很难，很伤心，想要回宇宙。
农学博士发明了一颗超级萝卜，他把它锁在了营养舱里。可是粗心的博士却忘了开舱密码。萝卜不能长久呆在营养舱里，必须在30天内把它拿出来。能够开启营养舱的另一个方法是完成幻镜任务。所以，博士将这个任务交给了阿U和他的小伙伴胖仔、阿美和男人婆。可是以兔菲为首的三只兔子早就对萝卜垂涎三尺，它们抢走了幻镜。为了抢在兔子之前开启营养舱拿到萝卜，博士给了阿U等人另一台幻镜。孩子们和兔子们打开幻镜，不停得到任务指引：解密汉字拼音，得到下一个阶段任务地点方位；寻找七巧板，得到下一个任务地点方位；完成英语字母连接，得到下一个任务地点方位。兔子们会在阿U进行任务解析时捣乱，阿U也依靠自己的聪明才智，挫败兔子。于是，一场妙趣横生的对抗赛上演了。
陆国国君身中剧毒，性命危在旦夕，消失5年的儿子陆尘强势归来，一改以往废柴的人设，摇身一变成为实力强横又多金的存在，只见他不费吹灰之力，拯救陆国于水火之中，动动手指便解除老爹身上的奇毒，究竟是什么让陆尘改头换面？听说是有好几个美女师父？
远古巨兽，现代人类，未来科技，时空混乱的荒岛；石器时代，动力时代，电气时代，飞速发展的荒岛文明。流落无人荒岛，开局一个系统，秦天从零开始求生。校花女神，金发御姐，暴走萝莉，我统统都要；驯金雕，收狼王，退巨蟒，这座荒岛，由我做主！
马诺、丁凯和兰欣儿在丛林里告别大家后搭乘直升机回家，途中突遇火山爆发，飞机迫降在爪哇岛丛林中，大家决定寻找失散的马诺，开启新的火山冒险旅程。
这个星球被DS（达摩克里斯）科技军队占领，强AI（人工智能系统）是这个军队的首领。反抗AI和DS的鹰隼部队，对疯狗镇（DS试验场）进行肃清。原为疯狗镇电工却拥有既视感（短暂预测未来）的马三、神秘女子洛凝和改造人翎以及黑客小海一同反抗并逃亡。疯狗镇的主人（“神父”莫比）乘火箭逃离殖民星球，疯狗镇的众人即将被火箭烈焰活活烧死，马三为救众人连接了AI天眼卫星，成功阻止神父并和众人逃出了疯狗镇，这一举动暗示马三可能来自DS，马三也开始对既视感的来源产生怀疑？ 众人来到被一群末世难民占领的废弃驿站，这里的首领封子昂认出马三，称呼他为长官，随即自愿帮助马三找回记忆，但殊不知，这只是一场阴谋的前奏……
天下第一医师徐长灯坠崖身亡，其女徐悠然前去投靠瑞王爷，不想路上遭侍女毒手并失忆，而侍女青露则趁机冒充前往瑞王府想要成为世子妃。让人没想到的是，如今在悠然身体里的，是曾震慑江湖的毒医妖女，乐千秋的灵魂。毒医重生，曾经掀起血雨腥风的她，该如何度过这一世呢？
本剧讲述超级飞侠与超级宠物们乘着迷你基地前往世界各地旅行，在旅行过程中邂逅世界各地的小朋友，并帮助小朋友们解决种种困难和问题的故事。如在冰岛海域，他们通过声波探测设备，帮助海豚宝宝找到了海豚妈妈；在喜马拉雅山脉附近，他们把快要滚下山坡的小男孩基玛和爸爸以及巨雪人宝宝安全救下。尽管困难不断，但超级飞侠和超级宠物们每次都会带着炫酷的装备，圆满地解决问题。
乐小宇受力奥和剑齿虎的委托，需要穿越到过去不同的时空，寻找分裂成十块的核晶碎片。与此同时，外星钶龙奥米伽为了抢夺核晶，也陆续派出十大钶龙属下前往地球。为了阻止核晶被抢、地球被侵略，乐小宇和同伴福星、立夏先后唤醒了以霸王龙为首的多个远古钶龙加入队伍，共同展开一场又一场惊心动魄的热血冒险历程。
