未来，人类把住所迁移到了月球。 让居住在月球殖民地的人们为之疯狂的是“克罗诺斯公司”出品的大型娱乐生存游戏“逃走中”。 那些完成严酷任务，成功从追踪机器人——猎人手中逃脱的人，将获得高额奖金和超高人气，成为少年们憧憬的存在。 拥有超强身体能力的托姆拉飒也，命运般踏入“逃走中”世界。 被转移到前所未有的宏大舞台的飒也，一边面对来袭“猎人”的威胁和种种考验，一边与怪人聚集的逃跑者们一起，以逃脱为目标开始“认真”逃跑！
某天，高中生横谷家突然来访了一位上门营业的女仆—— 之前的职业是杀手，并且没做过家务活…… 满心疑惑而又无法拒绝的老好人男主感受到她的纯粹，于是接纳了她。 让只影独行在黑暗社会孤独生活的女仆，成为家人的故事开始了……
幼时曾深陷绝望深渊的直枝理树，与4位少年少女相遇了。 在那之后数年，理树作为Little Busters的一员，喧闹地过着快乐的每一天。 这样的时间能够一直持续就好了。理树所期望的只有这样。 某日，恭介突然表示要成立一支棒球队伍， 理树则开始了寻找成员的任务。 在这样的过程中，理树邂逅了新的成员们。 和大家一起参加试胆大会，潜入女生宿舍时被换上女装，一起演人偶剧……。 经历了许多快乐的事情， 同时也在大家的帮助下解决了各自拥有的烦恼。 最后在棒球比赛中，理树确认了和最好的朋友们之间的牵绊。 ——然而，这并不是结束。 和来谷唯湖之间的故事。 理树与铃的故事。 以及，理树和铃终于知晓的“世界的秘密”。 Little Busters真正的物语，自此开始——。
“為せ 汝の欲することを” かつて世界を救った英雄達がいた。 数多の英雄達は〈破壊〉の力と戦い、 この世界を守ったのだ。 そして、時は流れ―― 英雄たちは歴史の彼方へと去り、 彼らの力を身に纏い戦う〈継承者〉と呼ばれる 少年少女達に世界の運命は託されることとなった。 〈継承者〉の頂点に立つ〈セブンナイツ〉の一人、 少女ファリアは押し寄せる〈破壊〉の軍勢との戦いの中、 ネモと名乗る一人の少年を救う。 激戦の中、 ネモは自らも知らぬままに〈英雄〉の力を喚起し、 〈継承者〉としての力を振るう。 だが、彼の〈英雄〉は 誰も知らぬ、誰も語らぬ者だった。 そしてこの時より始まるのだ。 過去と現在の交錯する魂の旅路が――
