故事围绕着一个外表看起来阴暗到会被周围人称为“贞子”的女高中生黑沼爽子展开，描述她通过努力逐渐消除周围人的误解，并得到友情与爱情的故事。有着浓黑长发，惨白皮肤的黑沼爽子的座右铭是“日行一善”，喜欢帮助他人，所以一直担任班级委员，由于小学时不小心得到了“贞子”这个绰号，导致周围人以为和她接触会受到诅咒而不敢与她交朋友。上高中后，在受到过自己帮助的同学风早的带动下，逐渐融合到班级中，被改称为“座敷童子”，认为“看到贞子笑的话会有好运”。爽朗王子与“贞子”女生的校园轻喜剧登场啦……
在一次对治某村庄食尸鬼的超自然事件时，平凡女警女警西洛斯·维多利亚遭到袭击，奄奄一息，关键时刻吸血鬼杀手阿尔卡特出现，铲除食尸鬼，并将西洛斯变成了吸血鬼的一员，她顺理成章也接触到了阿尔卡特背后的神秘组织，即为维护英国基督新教、与反基督怪物作战的皇家国教骑士团（Hellsing），在现任当家伊塔古拉·方布鲁克·维英格茨·赫尔辛的率领下，他们接手一桩桩危险且阴谋重重的任务。在这一过程中，与食尸鬼有关的事件层出不穷，死后背后有另一个神秘组织正在策划惊天阴谋。梵蒂冈特务局第十三课Iscariot机关局长安利哥•马克斯威尔、安德鲁森神父等重要人物相继现身，为了保护英国本土和基督新教，第九次十字军成立，而他们的对手则是纳粹余孽少校所率领的1000头食尸鬼组建的千禧年大军。 伦敦上空阴云密布，前所未有的正邪之战拉开序幕……
公爵千金卡塔莉娜．庫萊耶思因為頭被石頭撞到而回想起了前世的記憶。這裡是她生前沉迷的女性向遊戲「FORTUNE LOVER」的世界，而自己則是妨礙遊戲主角戀情的壞人大小姐！ 遊戲中為卡塔莉娜準備的結局，要不是被流放到國外…要不就是被人殺害…一定要想辦法避開這些毀滅END，將幸福的美好未來弄到手！而順利迴避毀滅結局的卡塔莉娜這次即將面對新的危機！？ 各種會錯意與不自覺的迷人功力交織而成的戀愛喜劇，現在即再次揭開序幕。
小五郎应京都寺院的邀请，前往京都调查寺内八年前佛像盗窃事件。寺院早前得到佛像下落的线索，是一件有不同图案的图画，提供给小五郎，以便尽快寻回佛像。同时间，东京、大阪和京都发生杀人事件，三个城市的警方调查后，发现事件中的死者都是盗贼团“源氏萤”的成员，毎人都有一个代名，以《义经》内的传统人物命名。 服部亦因此事，前往京都调查杀人事件的真相。期间遇上柯南，两人一起调查两宗事件，发现两宗事件都有共同点，有助解开八年前佛像盗窃事件。在调查期间亦发生杀人案，服部因此而受袭，和叶亦因查找施袭者线索而被人挟持。
公元2030的世界，改造人、生化人、机器人等等的存在已经非常普及。主人公草薙素子正是人类最高科技的结晶：只有大脑是人脑，其余身体部分皆为机械装置，外表看起来则是一名美貌兼干练的年轻女性。在这个高科技的世界里，人类通过更换身体的各个部件而达到长寿已不是新鲜事，更有许多人的大脑也已经电脑化，从而真正实现所谓的“电子化的存在”(并非“信息化的存在”)。从庞大的社会结构直至单独的个人身体，都可方便的通过网络连接，构成了一个无比复杂的信息网络：这就是本作的世界基础。 虽然人类社会的电脑化带来很多方便，但是无论构造成为身体的材料怎样变化，人类毕竟还是拥有人性，因此各种以电脑为契机的犯罪层出不穷。日本的公安九课是一个高出统治阶层的存在，它的职能就是猎捕一切有关于高级电脑类刑事犯罪者。公安九课所面对的罪犯：有时可能是政府中的高官，有时可能是偷换他人大脑的投机分子，更有可能是身边的同伴；每一次的案件，都是对人类存在的再思考，都可能给队内的每一个队员带来沉重的精神压力。
