神奇阿呦第二部全集故事讲述的是在神奇阿呦第一季最后一集中阿呦为了给小米去掉颜料，前往别的星球，机器流星人利用阿呦的善心逃脱，却引来了一个真正的流星人阿巴。阿呦把流星人阿巴带回小米家，但小米嫌它吵，阿巴就跑出去了。阿巴觉得实现别人的愿望很难，很伤心，想要回宇宙。
家族长老为争夺矿上开采权，派人碎他丹田，从此成为叶家弃子。然而他却因母亲流血的戒指意外进入界狱塔，得神秘人指点，修炼从未有人修炼过的剑道。叶家弃少叶玄：“我必须变得强大，那样才能保护妹妹，夺回我在叶家失去的一切。”神秘女子：“跟着我，我让你成为诸天界最强剑士。”在神秘女子的帮助下，叶玄能成为诸天界最强剑士吗？
监国独揽朝政，漠北大军来势汹汹，岐国独木难支，且看李星云如何带领不良人绝地反击！
