喜羊羊与灰太狼意外被带到了未来世界，为了回到自己的时空，二人与未来的小羊们收集分散的象星石碎片。但过程中，一神秘反派也派遣厉害的手下来抢夺碎片，于是双方势力开展了精彩纷呈的碎片争夺战。
枪神记讲述了基因锁作为一项神秘降临的超时代科技，它能促使人体机能在速度、力量、感官等得到空前强化。成功打开基因锁的人成为新时代的“特工”，而特工中的佼佼者们被称为——“枪神”。围绕基因锁这一新型军备，各势力激烈斗争，纷纷成立学院培育特工。随着实验的突破与应用，同时来自神秘种族的胁迫，更让世界逐步陷入战争的泥沼...战乱结束之后，神秘种族消逝殆尽，特工、枪神更成为无从证实的都市传说，仅剩的两大特工组织“深海”与“荒蛇”分别将基地迁移至海底和地下，互不相扰。然而一派和平景象下，实则危机四伏
腼腆内向的小羊驼三三来到新的地方生活，遇到了什么都不放在心上的外星生物饼干鱼，以及内心脆弱、外表凶悍的寄居蟹蟹麻麻。一群小伙伴从看似舒适的壳中走出来，在找寻自我的同时，邂逅了更多的友人，在平凡的生活中收获了无数温柔。一颗“流星”撬动了某条凝滞已久的世界线，开启了“有问题”的新故事。
