神奇阿呦第二部全集故事讲述的是在神奇阿呦第一季最后一集中阿呦为了给小米去掉颜料，前往别的星球，机器流星人利用阿呦的善心逃脱，却引来了一个真正的流星人阿巴。阿呦把流星人阿巴带回小米家，但小米嫌它吵，阿巴就跑出去了。阿巴觉得实现别人的愿望很难，很伤心，想要回宇宙。
在初唐，一位胸怀大爱的智者玄奘似乎找到了解救世人的方法，传说玄奘法师为十世金禅转世，在这十世间玄奘以不同的身份、不同职业不断地寻找解救世人的方法，在经历九世的失败后，玄奘终于悟得济世法门---【治心才能治人】。
该片以海洋作为故事上演的舞台，融合了动作、探险、海洋生物科学课程以及学龄前团队协作等内容。 动画讲述了八个可爱小动物组成的海底探险小队的故事。他们居住在神秘基地——章鱼堡，随时准备出发去解决海底遇险、排除海底可能发生的危险。 每集动画都建立在一次探险的基础之上，小队成员发挥自己的特殊本领，克服险境，探索海洋奥妙，发现未知生物。高潮迭起的探险、拯救、保护情节不断激发着孩子们的思考能力，培养他们互相协作友善真诚的团队精神。 本片具有高品质的美术和故事设计，精致的3D动画制作，欢快动人的片尾音乐，将晦涩抽象的知识融入到生动有趣的画面和剧情中，孩子们透过小纵队的视角展开奇妙的世界画卷，感受丰富多彩的自然奇景，在欢乐享受的同时学习到诸多的科普内容，不断找寻着关于人与自然关系的答案，着重强调了团队协作、互相帮助的友谊精神。
