主人公キイチくんは自分もまわりも不幸にしてしまう体質で、自分が思いを寄せるさくらちゃんに10億円もの借金を背負わせてしまったことから、時給10万円を提示する「地獄ようちえん」でアルバイトを始めることにした。しかし、そこは世界征服を目論む悪魔の園児たちが集う幼稚園だった。
波多野宪二对高速水上赛艇绕圈比赛中猿之回旋充满狂热，所以他决定成为一个赛艇选手。波多野宪二在大和赛艇学校里学习以超过一年了。跟着他终于获得第一次以赛手资格亮相！！ 在他那顽固的导师教导下，他每天都要施展浑身解数同和他敌对的同班同学洞口雄大及更多能手较劲。为了实显他对童年女伴许下的诺言，波多野宪二不顾一切的在水上驰骋！！
这里是，“人”“神”“魔”各个种族混杂在一起的神秘世界密斯塔尔希亚。快活的玛娜莉亚王国公主“安”，内向的龙族公主“格蕾尔”。自两人的相遇之后，玛娜莉亚魔法学院的生活开始了。
随着恶魔觉醒，人类世界陷入混乱。性格温柔的男孩与恶魔合体，在神秘好友飞鸟了的指引下，卷入一场残酷、堕落的对抗邪恶之战。
表面上看来，藤宫香织（雨宫天 配音）是一个再平凡不过的高中少女，然而，很少有人知道，一种罕见的疾病让香织的记忆只能维持一周的时间。曾经感情要好的朋友、让人快乐的事情，只要一周的时间一到，就会统统忘记，背负着这样的痛苦，香织压抑了自己的感情，带上了冷酷的假面，过着离群索居的孤独生活。 香织诡异的性格让开朗乐观的男孩长谷佑树（山谷祥生 配音）感到十分好奇，他主动接近香织，提出了要成为朋友的请求。得知了香织的病情，佑树并没有退却，周复一周，他凭借着自己的善意，一次又一次地和香织成为了朋友，随着时间的推移，一种坚实的羁绊在两个年轻善良的孩子之间产生了。
故事的舞台是互联网系统发达的都市「DEN CITY」。 在那里有经由巨型企业「SOL技术社」通过高度的网络技术构筑而成的被称为「LINK VRAINS」的VR空间。人们都在那个VR空间中为体验到全新的决斗而狂热。可是在「LINK VRAINS」中却出现了利用决斗来进行黑客行为的谜之黑客集团「海诺因骑士团」。而他们的目标是将存在于互联网的某处的“AI们的世界=电子界”毁灭。 然而在世界受到这样的威胁时，有一名决斗者站了出来。而他的名字正是「Playmaker」。 在那场传奇的战斗中，「Playmaker」使用压倒性的决斗将「海诺因骑士团」打倒，成功捕获了「SOL技术社」和「海诺因骑士团」都想要得手的迷之AI程序。一度拯救了世界，然后却突然消声匿迹了，而他的名字就在互联网的世界中一瞬间变得声名远播，成为了传说。 而现在，作为「Playmaker」的正体的某位高中生藤木游作，为了寻找过去发生的某件事件的真相，对再次在「VRAINS」出现的「海诺因骑士团」展开了追击...... 以此为契机，命运的齿轮就此转动…… 迷之AI的真身，「海诺因骑士团」盯上「Link Vrains」的目的，以及隐藏在游作过去的真相到底是——— 所有的答案，都在「Link Vrains」中
