飞伦擎锋两兄弟在宇宙能源战士展森的指引下，踏上了解决能源危机与地球环境问题的冒险之旅。两兄弟在冒险的过程中结识了来自世界各地的小伙伴与十二辆爆裂飞车。随着冒险的进一步深入飞伦等人发现，原来地球上的种种环境问题都源于一位叫作赤魔的宇宙大魔王。他为了统治宇宙正指挥着自己手下的魔暗军团不断地掠夺地球能源，并意图夺走整个地球能源的核心——奥能核心。于是飞伦带领着一众伙伴与十二辆爆裂飞车相互配合，最终击败了赤魔与魔暗军团，守护住了地球乃至宇宙的和平与安全。
本动画片故事内容以单元剧为主，在每一集中，拟人化飞机主角乐迪都会飞往世界各地不同的区域，为小朋友们递送他们所需要的包裹，因此观众们将跟随乐迪穿梭于世界各地，看超级飞侠团队运用各自团队的过人能力，帮助小朋友们解决困难。同时，本片中还会呈现世界各地的文化特色，如当地的常用语、当地有名的美食、名人趣事以及有趣的风俗习惯等。通过这部动画片，孩子们能够从中感受到快乐，拓展对世界各地文化的认识，并且学习到超级飞侠和小朋友们团结友爱、热情善良、互帮互助、一起成长的美好品质。
数百年前，灵气复苏，人人皆具灵性，欲望开始爆发，混战开始产生，一代圣尊凌云峰和一群生死弟兄们历经浩劫，凌云峰修成了无敌的存在，以大威能一举平定了乱世，迎来了万世和平。 然而，虽然和平降临了，凌云峰突然收到来自道宗掌教的一封密信，发现她居然和自己有了一个儿子，引出了一段孽缘，然而祸不单行，凌云峰发现自己在无敌之前，在自己不知情的情况下，结下了很多孽缘，包括魔宗掌教、妖族女帝、药王谷神医传人、天下第一商女家主、佛总圣女等，凌云峰虽然修为，谋略当世无敌！但是在恋爱与养娃的战场上，他的经验值是0！
在本季《超级飞侠12》中，超级飞侠依然会接收来自世界各地小朋友的电话，为小朋友定制他们需要的特别的东西，并将东西送到他们手上。当小朋友们遇到困难，乐迪会请求总部的帮助，超级飞侠将带来拥有各种属性的愿望能量球，和小朋友们一起摇身一变成为酷炫的愿望守护者，陪同小朋友一起解决问题。而上一季新登场的三位超级飞侠新成员：恐龙飞机超级飞侠大壮、速食卡车超级飞侠糯糯、高速火车超级飞侠咚咚，也会在这一季中展示他们的过人之处。而当困难升级，超级基地也会变成超级机器人，跟超级飞侠一起陪小朋友们度过难关。
十方天域，强者为尊，少年林天被未婚妻萧韵联合莫家长子莫森骗光了家产，还被推下悬崖。侥幸未死的他终于幡然醒悟，决心向两家复仇，夺回属于自己的一切，在悬崖之下，他偶获神秘黑铁剑，此剑暗藏神功，竟助他炼成无上武道。因实力不足，他决定先拜入九阳武府，待实力成熟后再行复仇，不料武府长老却是莫森的大伯，林天内外交困，危机重重。林天开始低调行事，苦修武道，精修符阵之法，暗中出城历练，战赤面鬼，杀百足兽，夺血魂花，奇遇不断。他的实力飞速增长，萧莫两家却仍不知悔改，埋伏、暗杀，甚至发动全家势力进山围剿，而林天神功大成，自以一剑破之。且看少年林天如何喋血复仇，历经磨难，终成神王，一统十方之天界！
女娲娘娘为了造福人间，创造出了能够帮助人类的神兽，哪知道邪恶而又贪婪的元始天魔利用了善良的神兽，将它们污染变为了残暴的魔兽，驱使它们祸害人间，企图就此成为统治世界的霸主。 问天（马小冀 配音）是南宫城城主的儿子，一次偶然之中，他得到了神兽天晶兽（王凯 配音），让问天没有想到的是，天晶兽竟然幻化成为了神兵，拥有着足以打败魔兽的强大力量。与此同时，问天的妹妹问雅（刘旭莹 配音）从母亲的血脉里遗传了净化之力，能够净化遭到黑暗力量侵蚀的神兽，在兄妹两人无间的配合之下，正义的势力逐渐的壮大起来。元始天魔眼看阴谋无法得逞，于是召唤出了更加强大的敌人玄天邪帝。
