主角春日野悠和他的双胞胎妹妹穹在父母死于事故之后，来到了位于名叫奥木染的小村的祖父的家中，在那里开始新的生活。一边和不习惯的家务事奋战，一边还要照顾平时足不出户、什么事情都不会的妹妹穹，悠的生活变得异常艰辛。
在与昔日到访奥木染时认识的天女目瑛和依媛奈绪重遇、认识了新的朋友、和以前一样几乎没有变的城镇和人们。这令人怀念的回忆和温馨的环境，治愈着悠心中的伤痕。在这样的过程中，慢慢地发生了一些变化。儿时定下的只属于两个人的秘密约定以及所失去的重要东西的下落。还有，定下了这个地方的真正理由。很快悠注意到了对自己来说谁是重要的存在……
面对伤痕累累，一路蹒跚走过的她，悠要如何面对呢？在阳光灿烂的初夏天空下，故事，就这样开始了……
修次和千濑本来只是两名普通的中学生，虽然两人关系比较暧昧，但是由于他们都不善于谈恋爱，好不容易千濑大胆告白后两人尝试进行交往。原本，两人的青涩恋情应该正逐渐走上正轨时，意外却发生了。战争毫无声息的突然爆发，敌人的战机像下雨般空投炸弹。而这时，一个神秘物体却出现在天际，敌 人的战机被一架架的击落，一场危机暂时得到化解。而身临现场的修次，却清清楚楚的看到那击落敌机的神秘物体尽然是长着翅膀和巨大武器的千濑。原来，千濑是军方的秘密改造兵器，拥有不可思议的毁灭力量。千濑毫无保留地把这些秘密告诉了修次，修次面对这昔日的恋人，到底还是无法接受眼前的千濑。两人普通中学生的命运也因此而改变。
《 ViVid Strike ! 》TV未放送第5.5话、第5.75话、第13话。
