為了與犯罪組織古萊姆（クライム）對抗,國際科學特搜隊的鯨井大助決定組織一隊改造人部隊，最後他找到接受手術的四人，分別是：櫻井五郎、東竜、嘉琳·水木（カレン水木）及大地文太。四人背負著改造人失去肉體的痛苦，與古萊姆周旋。 後來因古萊姆引入了侵略機械人，把目標由犯罪轉變成征服地球。因此皇牌突擊隊亦加入了行動隊長Big 1（ビッグワン），令戰況更加白熱化。
人类消失后，地球经历了漫长的岁月。 位于日本首都东京银座的「银河楼」酒店，至今仍在营业中。 工作人员是以酒店机器人八千代为中心，在各个部门工作的员工机器人们。它们一边等待老板的归来和再次迎接人类的时刻，一边在没有住客的酒店里专心致志地工作，这样的日子仿佛永无止境。 而对于这样的八千代等人，现在，小小的奇迹即将发生——
拥有大量资产的神户家少爷大助前往赴任之处， 是仅会接收在警视厅引发问题之人的 「现代犯罪对策本部准备室」，通称「现对本部」。 大助在那里与重视人情的男人·加藤春组成了搭档。 面对连人命都以价钱衡量的大助，加藤以「世上并非只有金钱」加以反驳。 而各种各样的事件和谜团，阻挡在这对立的2人面前。 超越常识的搜查现在开始——！
彼得（下野紘 配音）是隶属于亚格巴契战士公会的战士，曾经在武斗祭上夺得头筹，被誉为地表最强人类。彼得的最大梦想就是能够成为世界上最强的男人，然后迎娶自己的青梅竹马露薇莉亚（二之宫唯 配音），现在，他离实现梦想仅剩最后一步了。 然而，让彼得没有想到的是，自己所拥有的强大力量和高涨的人气吸引了各族女子慕名而来，她们都想获得继承了这强大基因的孩子。古灵精怪的鬼人族姐妹莉莎（山村响 配音）和美美（竹达彩奈 配音）、性格高傲总是拿鼻孔看人的高等精灵薇绀（上原明里 配音）、个性非常内向，总是缺乏自信的兽人皮格莉特（千本木彩花 配音），这些女子们为了争夺彼得的种子开始了较量。
并不平静的一天，变身为假面骑士OOO的火野映司（渡部秀 饰）协同伙伴Ankh（三浦凉介 饰）与修卡战斗。谁知关键时刻，战局突然发生意外，一列时空列车DenLiner不期而至出现在二人面前。他们见到了可以变身为假面骑士电王的幸太郎（樱田通 饰），为此大为惊讶。二人趁乱登上列车，然而列车长严厉禁止他们下车，以免扰乱历史走向。列车回到了1971年，假面骑士电王与异魔神展开输死决斗，而就在此时，Ankh偷偷留出车厢寻找硬币，最后被映司等人抓了回来。当他们重返自己所处的时代，发现整个世界已经天翻地覆，修卡前所未有壮大，几乎统治了全世界。 不肯认输的映司和Ankh与修卡展开战斗……
