故事发生在一个名为楢崎町的小镇上，这是一个拥有着神秘魔法力量的神奇小镇，在小镇的天空中，永远都挂着一道绚丽的彩虹，而在传说中，神明会实现居住在这个小镇里的人们每人一个愿望。 天海春彦（泰勇气 配音）是从小到大都生活自镇上的青年，一天，班上来了一个名为深峰莉子（清水爱 配音）的转校生，让春彦没有想到的是，这个女孩竟然是自己的义妹，他们在年龄很小的时候分开了，想不到命运的红线令两人于此时此刻重逢。莉子的出现让春彦的青梅竹马木之坂雾乃（宫崎羽衣 配音）感到了强烈的危机感，她一直默默的喜欢着春彦。
在纽约的罗斯福岛上，四位女主角凯特、萝丝、克莱儿以及瑞秋她们经历了在此地发生的一连串神秘自杀事件。之后她们所就读的学校因为有学生自杀（似乎被卷入了这场神秘事件）而宣告停课，而她们四人被一只神秘的蝴蝶引导到一处奇怪的地点，而她们却被一群神秘的人物宣告“死亡”；如果她们还要继续存活下来，她们只得别无选择地逐一猎杀眼前所出现的怪物。
远月学园迎来秋季选拔，获得选拔资格的创真迎来新的挑战。
“我对普通的人类没有兴趣。你们之中要是有外星人、未来人、异世界人或者超能力者的话，就尽管来找我吧！”这是围绕着被天上天下唯我独尊超积极任性女孩凉宫春日所指挥的阿虚和SOS团而展开的微妙的非日常校园故事。 或者说本作是：某女高中生想要和外星人、未来人、超能力者一起玩，于是就和他们（外加附赠的一个普通人）一起玩了的故事。 2009年4月至10月，动画再次播放，这次播放依故事发生时序，在14集旧作加上14集新作，共28集。
BD&DVD各卷收录的特典动画短篇，共6话，收录TV版未播放的一些场景画面。 卷数BD&DVD发售日 12015年3月27日 22015年4月24日 32015年5月29日 42015年6月26日 52015年7月31日 62015年8月28日
