与莉可、罗伊以及帕底亚地区的三只最初的宝可梦们一起踏上激动人心的宝可梦世界冒险之旅吧！
《Classicaloid》讲述了住在依靠音乐振兴城市的某城镇中的高中生歌苗和奏助的面前，突然出现了贝多芬和莫扎特！这个自称为“Classicaloid”的可疑二人组所演奏的音乐“Musik”中有着奇妙的力量……星辰降落，巨大机器人出现，他们每天都过得紧张刺激。随后，巴赫、肖邦、舒伯特等Classicaloid也接连出现。
平穷的电视局，在缺乏人手的情况下，为拍摄寻找传说中的大章鱼克拉肯，摄影小组前往了魔之海域香蕉三角洲。
本作是以解谜为题材的原创动画，Phi-Brain是指拥有黄金比大脑之人，而主人公Kaito作为Phi-Brain的候补者之一，为解开传说中的“神之谜题”而展开一场冒险。 热爱解谜的私立√（Root）学园高一学生大門Kaito，在偶然的机遇下挑战了潜藏在学园近郊地下遗迹中的“不可解之谜”，那是由神秘的智囊集团POG所制造的、招致生命危险的“贤者之谜”。被真相激怒的Kaito漂亮地攻克了贤者之谜，意外地从中获得了“Solver(解答者)”的指名。于是Kaito与青梅竹马的少女Nonoha以及其他拥有解答者身份的同伴们一起，以存在于世界各地的“贤者之谜”为舞台，与POG展开解谜对决。
一个被「沙海」的黄沙的海洋所包围的世界--- 四季分立的大陆漂浮于其上，在那里，被称为兽人的种族支配着人类。 浮在沙海之上的一个小港口城市里工作的青年奇利艾。 「不管世界在什么地方，以什么方式灭亡，都与我无关吧…」 看到了最近在世界范围中引起轩然大波的“世界毁灭委员会”的通缉令， 这个一直顺其自然过日子的青年也只是这样嘀咕了几句。 有一天，人类的少女莫露特出现在奇利艾的城市。她每天都过着逃亡的日子。 这是因为她正是“世界毁灭委员会”中的一员，持有着相传拥有毁灭世界力量的秘宝「破坏之核(destruct code)」的人。 在相遇后，一起行动的奇利艾和莫露特。接着，因为某个契机，小熊族的兽人酷男托皮也加入其中。 三人一同踏上了毁灭世界的旅程。追捕三人的「世界救济委员会」的纳加和莉亚，只要收了钱无论什么依赖都会达成的跑腿专家阿卡恩。还有三人在旅途中遇到的各种各样的人类和兽人们。等待这两个种族混杂的世界的究竟是毁灭，还是救赎呢。
