妻子变成小学生。

　　美月（桥本千波 配音）和夕哉（间岛淳司 配音）虽然身为兄妹，却并没有血缘关系，父母的重新结合让两人住到了同一屋檐下。个性有些傲娇的美月对夕哉这个突如其来的“哥哥”态度十分冷淡，但随着时间的推移，美月发现了夕哉善良的一面。
　　一位名叫寿日和（小仓唯 配音）的幽灵少女出现在了美月的身边，寿日和告诉美月，自己死于一场交通事故并且丧失了记忆，脑海中唯一能够记得的就是自己非常非常的喜欢夕哉。寿日和附身在了美月的身上，希望能够借助美月的身体帮助自己了却夙愿归天成佛，然而，对于被附身之后态度变得十分奇怪的美月，夕哉究竟抱有着怎样的感情呢？

有一天，地球遭到了灰色外星人的袭击。 航空自卫队在外星人的攻击下束手无策，濒临覆没。拯救了航空自卫队的，是不可能存在的有着人类面孔的“传说中的生物”。 因这次事件首次意识到这种生物与人类在地球共存的国家，将他们称为“境界人”，并置于监视之下。 几年后……移民与不可思议的恐怖事件发生，某个机关在这个混乱的世界中成立了。 那就是“境界敢死队（MARGINAL SERVICE）” 这是一个专门打击“境界人”犯罪，并彻底掩盖他们的存在的机关。

小五郎应京都寺院的邀请，前往京都调查寺内八年前佛像盗窃事件。寺院早前得到佛像下落的线索，是一件有不同图案的图画，提供给小五郎，以便尽快寻回佛像。同时间，东京、大阪和京都发生杀人事件，三个城市的警方调查后，发现事件中的死者都是盗贼团“源氏萤”的成员，毎人都有一个代名，以《义经》内的传统人物命名。 服部亦因此事，前往京都调查杀人事件的真相。期间遇上柯南，两人一起调查两宗事件，发现两宗事件都有共同点，有助解开八年前佛像盗窃事件。在调查期间亦发生杀人案，服部因此而受袭，和叶亦因查找施袭者线索而被人挟持。

　　故事发生在一间名为“GLASS STUDIO AMATO”的玻璃工坊，在这里坐镇的，是拥有丰富经验的吹玻璃手艺人小松诚二（日野聪 配音），虽然小松吹制玻璃的手艺十分高超，但地处偏远的工作室鲜少有客人拜访，这令小松感到十分困扰。
　　除了小松外，这里的长住客还有一只名为穆柯（吉田仁美 配音）的柴犬，它拥有着光亮滑润的皮毛和闪闪发光的鼻子，每天元气满满的上蹿下跳。穆柯和小松之间的关系十分亲密，小松信赖这位对自己悉心照料的主人，总希望有一天主人也能够变成小狗，走进自己的世界。除此之外，外表恐怖内心温柔的网页设计师牛岛厚平（间岛淳司 配音），酒吧老板棒田先生（藤原启治 配音）和他的女儿玲奈（上坂堇 配音）都是穆柯的好朋友。

　　全人类因谜般的现象而在一瞬间石化，之后过了数千年——。                                    
                               　　拥有超越人类的头脑，天生的科学少年·千空苏醒了。                                    
                               　　“从石器时代到现代文明，要跨越这科学史上的200万年！”。                                    
                               　　在这走投无路的状况中，千空寻找着伙伴，决心取回原先的世界！                         

　　本剧是由3位虚拟油管主主演。出演本作的虚拟主播为时乃空、猿乐町双叶、响木青，她们将饰演居住在东京下町父母双亡的四月一日家的三姐妹四月一日一花、二叶、三树。母亲在她们幼小时去世。父亲也在去年去世，姐妹三人居住在父亲留给她们的独立家屋中。三姐妹的共同生活是她们聊天的中心内容。每一集都以他们日常发生的各类“事件”为故事发展的背景，虚拟偶像的姐妹三人如同真人一样极度真实化的进行女生间的杂谈，推进故事的发展,酝酿出搞笑的戏剧情节。

　　某天，家里蹲的啃老族绪山真寻一觉醒来发现自己变成了“女孩子”！？正当真寻不知道镜子里的美少女是自己而陷入混乱的时候，跳级进入大学的科学家妹妹绪山美波里出现了。她透露在饮料里加了一种奇怪的药物！
　　真寻最近2年一直疯狂宅家玩小黄游，偶尔不得已才会工作！突然成为女孩子开始生活的真寻，对于厕所、浴室、裙子、胸罩等女人的生活完全不懂…并且他和美波里中学时期的同学穗月枫和其妹妹穗月椛认识。
　　真寻的日常生活逐渐热闹起来。在持续的苦难中，“前”哥哥的命运会如何...！