时值19世纪末，大不列颠盛世的伦敦—— 莫里亚蒂伯爵家长子‧艾伯特非常厌恶深植于这国家的阶级制度。而在结识了家中从孤儿院收养来的一对兄弟后，他决定推动净化世界的壮阔计划。名侦探夏洛克‧福尔摩斯的宿敌·莫里亚蒂教授背后不为人知的故事正式揭幕！
自那之后已经过去了5年。Amazon几乎被驱除，世界趋于和平。但是被Amazon细胞感染的普通人Amazon化的现象在持续发生扩大，为此政府组成了新组织4C，秘密驱除Amazon化的人类。 其中，幼年时期被Amazon养大的少年·千翼变身假面骑士Amazon Neo与Amazon战斗。但在被生来的吃人冲动所驱使的他的面前出现的是，变身为乌鸦Amazon并作为生物兵器战斗的少女·优。对于这样的优，他第一次没有产生“想吃”的想，并被她吸引着。而优的真面目是被Amazon化的父亲杀死后，作为Sigma型而复活的Amazon。
1989年，日本。 乔纳森·乔斯达与DIO决战后的一百年，DIO复活了。同时，乔瑟夫的孙子，空条承太郎发现自己有幽波纹（替身）能力，DIO的复活影响了没有替身抵抗能力的母亲，陷入病危情况；为了拯救命在旦夕的母亲，承太郎与乔瑟夫出发前往DIO的所在地——埃及。
一次偶然的机会，年仅10岁的平凡女孩森泽优得到了神秘力量，可以变身成为16岁拥有甜美歌喉的美少女小甜甜。小甜甜一下子成为了众人的偶像，连优暗恋的青梅竹马的伙伴俊夫都对小甜甜很着迷。成为偶像的优即开心又苦恼，忙着掩饰自己的身份，不想这个秘密被揭晓，打破自己正常的生活；另一方面，却又很想告诉俊夫，那个他喜欢的小甜甜其实就是自己。 16岁外表的偶像歌手，内在却是10岁女孩的心。平凡的生活被这魔法所打乱，惹出不少爆笑的故事，而只有2人参与的三角恋情却给这欢乐的故事蒙上一层忧伤，跟随小甜甜的美妙歌声，故事渐渐展开。
