依赖药水活下去！

非常喜欢给女生剪头发的初中生少年灰村切，某天放学回家时走进一栋西式建筑里，在那里他遇到了有着一头美丽的黑色长发少女武者小路祝。小祝的头发由于受到了诅咒，所以自出生以来不管用什么方法都无法剪断。然而，灰村切使用了自己当作护身符随身携带的剪刀成功剪断了小祝的头发。自此，身份是“发之女王”后代的少女与即使身为携带“杀害遗物”的杀人魔子孙但还是想守护这位少女的爱与战斗的故事开始了！

　　故事描述女主角小樱（木之本樱）与男朋友小狼（李小狼）和其他同学从小学毕业后升上初中的故事。                                    
                               　　在一次小樱做梦梦到53张樱之卡上面的图案都消失了，一名神秘人物出现之后库洛牌都碎掉了，                                    
                               　　小樱从这个梦醒来翻开封印之书发现库洛牌都变成透明的了!                                    
　　在与知世、小狼和艾力欧的讨论下，小樱重新踏上了收集透明牌的故事。 

　　故事发生在齐东高中内，这看似是一间再普通不过的学校，可实际上，在校园里徘徊着七只幽灵，流传着七段非常恐怖的灵异传说。为了维持学校的正常运营，校董成立了圣徒会。北城遥都（有马克明 配音）是一个做梦都想过普通人生活的男生，但命运偏偏不放过他，他被校董任命成为了圣徒会的会长。
　　除了北城遥都外，圣徒会的会员还有拥有极强灵感力的恋童癖巫女朝比奈睦月（仲间由纪惠 配音）和拥有附灵体质的和尚之子南堂和御（古本新之辅 配音）。他们所要应对的除了花子、二宫尊德、红斗篷假面等普通的幽灵外，还有一个隐藏的BOSS。

在冲绳合宿中，在由于朝阳的云隙光而达到了最高氛围值的桥上，雪村和冰室进行了理论值最高的亲吻，但由于采集的唾液量并不充足，于是决定再次测量。为拜访唾液检测的专家，一行人动身前往理工部生命科学学院。而他们面前出现的是花魁打扮配一袭白衣的艳丽女子翠雨，以及她的恋人克里斯。雪村邀请翠雨二人帮助他们一起完成“证明喜欢的实验”，却因此见识了翠雨他们压倒性的爱之气场……。

　　东京峰会召开在即，为了确保会议顺利进行，日本警方出动约两万名警力对位于东京湾的超大设施“海洋边缘”进行安保工作。可就在严密的防控下，此地已然发生了爆炸案。令柯南（高山南 配音）等人始料未及的是，现场居然留下了对毛利小五郎（小山力也 配音）极其不利的证据。在此之后，小五郎 遭到逮捕。柯南则发现安室透曾出现在爆炸现场，并且负了伤。为了还毛利叔叔的清白，柯南和阿笠博士以及少年侦探团的小伙伴们联合起来勘察现场，搜集证据。随着调查的深入，柯南发现这起爆炸案隐藏着包括恐怖分子、公安在内多方的复杂关系，而真相更令所有人瞠目结舌……
　　本片是“名侦探柯南系列”第22部动画剧场版，票房总收入超过90亿日元。