在科技发达的未来，网络上流传着一种真假不明、被称为“全息幽灵”的奇怪现象。 初中一年级的天之河宙，启动了父亲留下的“数码暴龙机”开始能看到大家看不见的未知生物“数码宝贝”......
人造人沙鲁战役过后，地球终于迎来了宝贵的和平，而骗子撒旦作为拯救了世界的英雄受到全人类的爱戴。世界首富钱多多为了给宝贝儿子庆生，出巨资举行了新一届的天下第一比武大会，成功晋级的选手有望和钱多多请来的四名所谓的外星人对决，最终获胜者还可以得到挑战撒旦的殊荣。此外，胜利者将得到一亿元奖金和环游世界的机会。超高的荣誉和报酬，连Z战士也坐不住了，纷纷报名参加。当然悟饭（野泽雅子 饰）、特兰克斯等人的出现，让撒旦心惊胆颤。一番较量过后，悟饭等人顺利晋级，但是等待他们的却是无比凶残和强大的宇宙人。 意想不到的敌人，地球新的危机出现……
故事以前作《科学小飞侠Crowds》的后续剧情展开。距离“立川事件”已经过了一年，当初贝尔库·卡切赋予尔乃美家累的力量“CROWDS”在日本首相菅山的推广之下已在人类社会当中广泛普及。然而仍然存在着对此感到不满的人们，此时菅山遭到不明人士的袭击，GATCHAMAN的全新战斗就此揭开序幕。
4月9日《境界线上的地平线》发表会上，制作方公布作品以2季的形式制作。
操作赛艇的“推进手”与使用水枪攻击对手的“射手”两人一组乘坐摩托赛艇，横越水面的运动“喷射竞速”成为主流的世界。母亲是传说中的推进手，自己也梦想成为喷射竞速选手的波黄凛，离开故乡所在的岛，来到了东京浅草。她在那里遇到了冰山美少女苍井美沙，两人成为了搭档。她们在与对手们展开竞争的同时，也逐渐加深着彼此的牵绊。
