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舞台位于乡下的名门女子初级中学——私立蜡梅学园。 有一位名叫明日小路的少女，梦想着能够穿上这所学园的水手服。 因为某个契机，她实现了这一梦想，于是在紧张中迎来了开学典礼的日子—— 「我要穿水手服」 怀抱着决心，少女梦想的初中生活就此展开♪ 同班同学、学校供餐、社团活动… 小路拼尽全力，奔跑在充满“第一次”的每一天！ 这是少女们闪闪发光的青春日记。 「我能交到很多朋友吗？」

　　人类遭逢了名为“空间震”的新型灾害。震撼空间、将一切破坏殆尽的这一灾厄，是由于精灵自临界显现而发生的。为了阻止空间震，使人类免遭灾厄而必须采取的措施，是使用武力歼灭精灵，或者是——“与其约会，使其娇羞”！                                    
                               　　让精灵娇羞，再通过“亲吻”即可封印其力量——拥有这种能力的高中生·五河士道。为了人类的和平，也为了拯救精灵们——士道在和她们的“约会”中来回奔走。对士道敞开心扉的精灵·十香、四糸乃、琴里、耶俱矢、夕弦、美九，为歼灭精灵而行动的AST，企图利用精灵的DEM，尝试与精灵对话的拉塔托斯克，以及，需要令其娇羞的新精灵——将这一切全部卷入，新的战争约会开始了——                         

平凡的大学生·野本裕也，与神秘少女·瞳相遇了。 在没有人烟的废弃场，野本目击到了她变成野兽的模样， 与狮子怪物展开死战的一幕。 他们的真实身份，是同时拥有人类的头脑与野兽的獠牙的“兽斗士”。 并且，瞳是隐藏着最强斗争本能的兽斗士“蜜獾”。 兽斗士们被自古以来支配日本经济的四大财阀三门、八菱、角供、石田所雇佣， 并作为其代理人展开决斗，争夺霸权。之后，野本通过再次与瞳相遇， 被卷入了这些兽斗士们的炽烈战斗“牙斗”当中——。

　　2022年，人类实现了现实世界和假想空间的融合，电子制造商开发了名为《刀剑神域（Sword Art Online）》的在线电子游戏。SAO甫一面世便大受好评，限量一万份的名额在发售当天的短时间内便被抢购一空。通过联网，玩家可以身临其境进入充满想象力和异域风情的游戏世界——浮游城市艾恩葛朗特。玩家在这里可以生活、练武、升级、经商、探险，与真实世界别无二致，却拥有无上的乐趣。曾是少数封测玩家的桐人（松冈祯丞 配音）也是这一万名幸运者中的一员。最初的兴奋过后，玩家们却发现根本无法顺利登出游戏，更为恐怖的是，一旦玩家的HP归零，现实世界中他们的肉体也将死亡。他们被SAO的开发者茅场晶彦（山寺宏一 配音）困在游戏中，顺利逃脱的方法似乎只有一个，那就是完成困难重重的攻略任务…… 本片根据川原砾的轻小说改编。

漫画《中之人基因组【实况中】》宣布了动画化企划进行中的消息，引起轰动的原因不明的连续少年少女失踪事件。
《中之人基因组》，在游戏实况者之间成为话题的神秘免费游戏。通称，失踪游戏。据称，在即将通关之际就消失的玩家源源不断。
失踪的游戏实况者们被人为地与外界隔离，集合到某座岛上。在那里，他们所接受的命令，是通过必须在现实中通关的各种游戏，来达成一亿的播放数。
8名人气实况者所带来的，以能否回归为赌注的真实游戏《中之人基因组》的实况开始了——