熟悉的偶像们，今天也是非常地吵闹，包含平常未被描写的偶像们度过假期的方式，和偶像们的搞笑剧等丰富多彩内容的短篇动画，终于要开幕了。
天医会综合医院，统括诊断部。 这里汇聚了其他医生认为“难以诊断”的患者。 甚至连警方都束手无策的“杀人案件”与“谜团”也…… 天才医生天久鹰央将揭开这些离奇“疾病”背后隐藏的惊人真相！ “这个疾病（谜题），由我来下诊断——！！”
一心想成为幽灵猎人的天空寺尊于18岁生日时，收到来自十年前亡父生前所寄的幽灵眼魂（Ghost Eyecon）后，来自异世界的怪人——眼魔突如其来地出现在面前并盯上此物，甚至为救青梅竹马月村明里和御成而身亡。得到仙人的帮助之下而获得Ghost驱动器变身，成为假面骑士Ghost并得以九十九日短暂的生命复苏。为收集实现复活愿望的「15位伟人」眼魂，投身于影响世界命运的战斗中。
为了探望身患重病的母亲，海棠晴（森川智之 配音）从日本远赴加拿大，待到抵达之时才发现，母亲的病危只是谎言，自己所要面对的，是自己横空出世素不相识的弟弟海棠零（皆川纯子 配音）。悲惨的童年经历令零幼小的心灵伤痕累累，他桀骜孤僻，不相信任何人，也不服从任何管教。 温柔善良的 晴用无微不至的照顾渐渐融化了零内心里的坚冰，当暑假结束晴要返回日本之时，兄弟两人约定有朝一日要在日本相聚。之后，一场车祸夺走了晴的一切，包括他和零在一起的记忆，当零千里迢迢来到日本之时，出现在他眼前的，是已经忘记一切面目全非成为牛郎的晴。
从行星波利斯逃脱等待重返地球的空间盘龙号，自称“雷奥尼克斯猎人”的神秘男子侵入其中。同时，其他的宇宙人们也正暗中开始行动，ZAP SPACY的船员们被捲入了这场争斗的漩涡中。就像凯特的遗言一样，崭新的雷奥尼克斯格斗已经开始了！？
