娆疆一行归来，李嗣源已称监国，借天子之名四处绞杀不良人，而身为天子的李星云也即将面临一个新的选择……
基因石被毁，不料基因石能量逸出，飘散到地球各处，引发了异常现象，故事从变形机甲、机甲兽和变异战士三方之间的斗争展开。
普利斯凭借拥有超星核的钢齿虎，控制了整个超好玩联盟的日常生活。表面上，外星居民都十分快活与自由，但实际上却是处处受控，甚至连基本生活作息都被彻底打乱。迷糊博士带领着猪猪侠等五名特工和超萌宠，为星盟的居民请命，解决困难。但一次意外，迷糊脑部受了重伤，成了一个神经兮兮的科学怪老伯，并与大伙失散了。在乌吧星城内，一边躲开普利斯的耳目，一边寻找迷糊博士的下落，猪猪侠等人疲于奔命。幸好在外星居民的协助下，猪猪侠和迷糊博士重聚，与此同时，普利斯也率领钢齿虎军团包围了整个迷糊博士的实验室。然而，迷糊博士一改昔日的逃跑战术，最终决定带领猪猪侠等人，堂堂正正地跟普利斯来一场萌宠科技大战。
