普通男子高中生加贺谷修一可以变身为怪物但并不是普通的怪物，而是布偶怪物，而且还是少女进入他的身体控制。这样过着日常生活的他，所热爱的日常，某天开始却突然不复存在……
舞台位于乡下的名门女子初级中学——私立蜡梅学园。 有一位名叫明日小路的少女，梦想着能够穿上这所学园的水手服。 因为某个契机，她实现了这一梦想，于是在紧张中迎来了开学典礼的日子—— 「我要穿水手服」 怀抱着决心，少女梦想的初中生活就此展开♪ 同班同学、学校供餐、社团活动… 小路拼尽全力，奔跑在充满“第一次”的每一天！ 这是少女们闪闪发光的青春日记。 「我能交到很多朋友吗？」
和父亲之间发生问题的不良少年，冈崎朋也，在前往学校的盛满樱花的坡道上邂逅了一名少女。少女名叫古河渚。 渚对朋也说「我无论如何也登不上这个坡道」，「希望跟在你后面登上这坡道」。 朋也向她提议，既然无法登上坡道，就争取在学校发现乐趣，只要发现乐趣，就一定可以登上。受到这番话的感化，渚开始努力重建被废部的演剧部。 然后，不知不觉朋也开始和渚共同行动，渐渐被渚努力的态度所吸引……
做事沉稳可靠，深受小弟信赖的大哥山本健太郎（小野大辅 配音）、脾气有些火爆，总是行动比头脑先行的立花亮（日野聪 配音）和对黑道生活充满了憧憬渴望能够干出一番大事业的杉原和哉（兴津和幸 配音）是黑道内的铁三角，却因为在一场意外之中做了错事而即将遭到老大犬金组长（藤原启治 配音）的惩罚。 犬金组长给了他们两个选择，一是以死谢罪，二是被送往泰国接受变性手术，然后以偶像组合的身份出道。最终，三人选择了后者，就这样，以爱理（贯井柚佳 配音）、真理（前田佳织里 配音）和千佳（赤尾光 配音）为核心成员的偶像组合后街女孩诞生了。
日本著名漫画创作团体CLAMP笔下的「奇迹少女KOBATO」，尽管不及同时连载中的「TSUBASA」和「xxxHOLiC」般引起轰动话题，但也以其清新治愈的风格得到读者的广泛支持。由MAD HOUSE根据其改编的TV动画，将从10月6日起每周二20:00在NHK-BS2电视台播放。预定全24话制作的TV版在原作漫画只发行了3卷单行本的情况下，届时该是会出现原创剧情了。剧中的女主角花户小鸠的声优将由花泽香菜担当，她那清甜的嗓音十分适合发挥演绎治愈型的小鸠，而狗型布娃娃的五百阿藏则由有着醇厚声线的稻田彻演绎。音乐方面，在声优和音乐界都有出色表现的坂本真绫将献唱片头歌，去年以MACROSS F而一举成名的中岛爱将献唱片尾歌。
