女学。～圣女斯克威尔学院～

　　现在，全世界所有人都在使用的智能手机App。
　　那里潜藏着无人知晓的存在·Applimonster，通称“Appmon”。
　　Appmon是具备能够自主思考行动的人工智能的App生命体，
　　在人类世界与数码空间的间隙中，为系统及人类发挥着机能。
　　但，潜藏在网络之海中的“凶恶的最终BOSS人工智能·利维坦”
　　化作病毒控制了Appmon们，并开始黑入各个系统，
　　企图从网络一侧控制人类的世界。
　　主人公少年·新海春，
　　获得了被伟大的意志引导的“App驱动”，
　　并使来自“App芯片”的搜索App·GATCHIMON实体化了。
　　隐藏在“App驱动”中的谜团，
　　处在Appmon所潜藏的网络世界与现实世界之间的不可思议的“场”，
　　以及2只Appmon进化的“App合体”到底是什么？“利维坦”真正的目标究竟是……！？
　　爱好读书的少年春，与搜索App的怪兽·GATCHIMON这一对凸凹组合，
　　奔驰于现代世界的新感觉搭档物语，
　　现在启动！

讲述的是，在阿斯特莱亚大陆最大的城市兰德索尔，失忆的男主人公与引导者kkju.ccコッコロ等人相识，为寻找自己失去的记忆，探求这个世界隐藏的真相，开始了冒险之旅。

黑暗女王复活篇                                                                      　　阿兔她们已经升上高中了，阿兔、亚美、真琴、美奈子同考入十番高中。被封印在镜中的死亡月亮纳美妮亚女王，被一把神秘的声音唤醒，那人替她解除封印，并煽动她的仇恨情绪，使她对美少女战士作出报复。她派出镜之舞孃袭击战士们，并藉流星雨把镜之碎片植入阿卫的身体内，慢慢控制阿卫。为了应付此一危机，雪奈复活并从土萌教授那里接回阿萤，去找阿遥和美智留，再次加入战斗。镜之舞孃袭击外部战士四人，仍是婴儿的阿萤被激发出力量，帮助其餘三位外部战士变成为SuperSailorUranus、SuperSailorNeptune和SuperSailorPluto。阿萤经此一役，身体和心智迅速成长，并再度醒觉，成为SuperSailorSaturn。所有美少女战士齐集，集合力量使阿兔变成终极形态Eternal Sailormoon。眾人担心阿卫，赶到他家时，他已被纳美妮亚控制，带走了。阿卫因为失去本性，不再爱阿兔，令他们的爱情结晶豆钉兔也慢慢消失。本来要变成Eternal Sailormoon是要靠眾人之力的，但阿兔救阿卫和豆钉兔心切，竟能独自变成Eternal Sailormoon，自己一个去纳美妮亚那里救人。其他战士也跟著追去，其间被纳美妮亚把她们分开，各个击破，封印在镜中。阿兔终於找到纳美妮亚和迷迷糊糊的阿卫，SuperSailorChibimoon就在阿兔的怀内消失。纳美妮亚诉说自己悲惨的过去，阿兔听了，只感到同情、可怜她，不再憎恨她，愿意让她报复，阿兔相信眾人都会愿意和纳美妮亚做朋友的。被封印的眾战士和阿卫都感动落泪，所有的封印解除，SuperSailorChibimoon亦重现世上。眾战士集合力量，阿兔变成Eternal Sailormoon，引导纳美妮亚找回她真正的梦想。                                                                      　　嘉拉西亚篇                                                                      　　阿卫要去美国留学，临走前送了一隻订婚戒指给阿兔，二人难舍难离。阿卫上机后，一道强光向他的飞机袭来...就在阿兔送别阿卫时，在机场出现了最新的人气组合---星光三剑侠(ThreeLights)，成员包括星野光、大气光和夜天光。星野和阿兔、阿卫擦身而过，他被阿兔吸引住了。新敌人袭击人类，要找出拥有真正星宿种子的人，但这次的敌人竟然也是美少女战士! 除此之外，又有三位来历不明的美少女战士SailorStarLights出现，她们有时会帮助内部战士。星光三剑侠转校来到十番高中，还坐到阿兔她们的附近。对阿兔有好感的星野，经常和阿兔在一起，而阿兔也对他渐生好感。经过一轮战斗，内部战士和SailorStarLights对彼此的认识加深了，阿兔正想和她们共同作战，外部战士突然归来，并反对和SailorStarLights合作。一天，神秘的小女孩小兔子从天而降，她令阿兔的家人相信她是阿兔的妹妹，从此寄住月野家。小兔子的真正身份没人知道，不过人人都喜欢她。在一次作战中，Eternal Sailormoon的权杖跌在地上，小兔子拾起它时，发出一道温暖的光，小兔子并变身成美少女战士SailorChibiChibimoon。这一道光引起了SailorStarLights和嘉拉西亚的注意。阿兔变身时不慎被敌人见到，敌人於是利用星光三剑侠飞机上的试映会作陷阱，引阿兔到来。在飞机上，为了救阿兔，星野不惜揭穿自己的真正身份 -- SailorStarFighter，也要保护阿兔。星光三剑侠就是SailorStarLights，内部战士的身份也被揭穿。敌人在战斗中偷袭 Eternal Sailormoon，星野扑上去替她挡下那一击，身受重伤。另一方面，小兔子拾得一个红色的香炉，内里有时会有一隻红色的蝴蝶出来飞舞。星光三剑侠发现了那香炉，确定那香味就是他们一直找寻的公主 -- 火球公主独有的气味，便想逼小兔子交出香炉。这时候，敌人出现以黑洞要胁，要夺走阿兔的星宿种子，阿兔为了大家的安全，无奈接受。因为敌人内鬨，黑洞被释放，阿兔和小兔子也被捲了进去。危急关头，小兔子手上的香炉发出强光，火球公主出现。火球公主讲述远古时代的美少女战士大战传说，请求大家帮助找寻希望之光。就在找寻希望之光的星光三剑侠演唱会上，敌人首脑嘉拉西亚出现，杀死了火球公主。美少女战士查出了敌人大本营在银河电视台，美少女战士各自出发，找嘉拉西亚作最后决战。SailorStarLights首先来到，内部战士也在SailorChibiChibimoon的帮助下来到。嘉拉西亚突然攻击，要夺取Eternal Sailormoon和SailorStarLights的星宿种子，内部四战士以身相挡，救了她们，自己则消失。嘉拉西亚对Eternal Sailormoon证实是她杀死阿卫的，Eternal Sailormoon情绪完全失控。外部战士明白自己的力量不及嘉拉西亚，於是想用计骗得嘉拉西亚的信任，乘机把她的星宿种子打出来。首先要牺牲的是 SuperSailorPluto和SuperSailorSaturn，Eternal Sailormoon误以为SuperSailorUranus和SuperSailorNeptune出卖同伴。外部战士的苦肉计因为嘉拉西亚没有星宿种子而宣告失败，SuperSailorUranus和SuperSailorNeptune也消失了。战斗到此，地球上的战士就只剩下Eternal Sailormoon一人，她失去了斗志。经SailorStarLights的鼓励回复斗志的她，再战嘉拉西亚，却惊闻嘉拉西亚就是传说最强的美少女战士 -- Sailor Galaxia! 嘉拉西亚在远古大战后，释放出她的星宿种子 -- 希望之光，然后身体就逐渐被体内的恶魔混沌侵佔了。SailorChibiChibimoon听完，掉下眼泪，原来她就是希望之光，现在觉醒化成封印之剑，请求阿兔用它来拯救银河系。阿兔犹豫，最终还是拿起剑，刺伤嘉拉西亚，不过封印之剑也被嘉拉西亚斩碎，SailorChibiChibimoon消失。阿兔相信仍留嘉拉西亚内心的希望碎片，伸出手飞向嘉拉西亚。                                                                      　　【美少女戦士最後星光各集主題】                                                                      　　第01话(全套第167話) 惡夢之花散開之時! 黑暗女王復活                                                                      　　第02话(全套第168話) Saturn的甦醒! 十位水手服戰士集結                                                                      　　第03话(全套第169話) 邪惡的魔鏡! 被惡夢捆綁的小衛                                                                      　　第04话(全套第170話) 命運的夜晚! 水手服戰士的苦難                                                                      　　第05话(全套第171話) 為了愛! 魔界中的無盡之戰                                                                      　　第06话(全套第172話) 愛的月之力量! 惡夢結束之時                                                                      　　第07话(全套第173話) 告別與相遇! 流星的命運                                                                      　　第08话(全套第174話) 學園掀起一陣風暴! 轉學生是偶像明星                                                                      　　第09话(全套第175話) 目標是成為偶像! 美奈子的野心                                                                      　　第10话(全套第176話) Fighter的真實身份! 衝擊的超變身                                                                      　　第11话(全套第177話) 夢與星星的羅曼史! 大氣的變身                                                                      　　第12话(全套第178話) 露娜看見了! 偶像夜天的真面目                                                                      　　第13话(全套第179話) 敵人?朋友?Starlights和水手服戰士                                                                      　　第14话(全套第180話) 呼叫著星星的光芒! 小遙等人參戰                                                                      　　第15话(全套第181話) 星野與小兔的令人心跳的約會                                                                      　　第16话(全套第182話) 來自宇宙的入侵者! Siren的飛來                                                                      　　第17话(全套第183話) 死亡靈魂的叫聲 恐怖的營區怪人                                                                      　　第18话(全套第184話) 兩個人的夜晚! 小兔的危機!                                                                      　　第19话(全套第185話) 大氣絕唱! 傳達信念之心的歌聲                                                                      　　第20话(全套第186話) 小兔子之謎 超級追擊行動                                                                      　　第21话(全套第187話) 光輝星星的力量! 小兔子的變身                                                                      　　第22话(全套第188話) 恐怖的招待! 小兔的夜間飛行                                                                      　　第23话(全套第189話) 使命與友情的裂痕! 水手服戰士對立                                                                      　　第24话(全套第190話) 揭露的真相! 星野等人的過去                                                                      　　第25话(全套第191話) 光之蝴蝶飛舞之時! 嶄新波動的預感                                                                      　　第26话(全套第192話) 通往夢想的直線道路! 偶像美奈子誕生                                                                      　　第27话(全套第193話) 被偷走的銀水晶! 火球公主出現                                                                      　　第28话(全套第194話) 銀河的聖戰 水手服大戰傳說                                                                      　　第29话(全套第195話) 火球公主戰死! 嘉拉西亞降臨                                                                      　　第30话(全套第196話) 銀河滅亡之時! 水手服戰士的最後決戰                                                                      　　第31话(全套第197話) 銀河的支配者 嘉拉西亞的威脅                                                                      　　第32话(全套第198話) 消失的星星! Uranus等人的死期                                                                      　　第33话(全套第199話) 希望之光! 為了銀河的最終決戰                                                                      　　第34话(全套第200話) 小兔的愛! 映照在銀河上的月光

　　故事发生在贵族私立学校斯特拉女子学院高中部内，雾岛莲都（牧野由依 配音）是刚刚进入学校就读的新生，对贵族学校之中优雅而又高贵的生活充满了憧憬，并且立志要加入充满了艺术气氛的美术部。然而，直到加入了美术部之后，莲都才得知，美术部和艺术根本就没有半点关系，而是一个利用BB枪和野战的形式来维护校园内部稳定和安全的“特别处置团体”。
　　除了莲都外，个性大大咧咧不拘小节的鹿岛园罗（泽城美雪 配音）、率真耿直的初濑卡莉娜（茅野爱衣 配音）、沉稳优雅聪慧过人的陆奥穗香（斋藤千和 配音）等人都是社团中的成员。

　　京都下鸭神社，居住于纠之森的下鸭家。继承了过去曾为狸猫界头领的亡父·总一郎的血脉的四兄弟，围绕着热爱宝冢的母亲，一直过着自己快乐的日子。
　　以继承了总一郎浓厚“傻瓜的血脉”的三男·矢三郎为中心，众人迎来了狂乱的一夜。自那一天，下一任“伪右卫门”的选举，叔父·夷川早云的策略，还有与“星期五俱乐部”之间发生的事，全都随着一阵风就这样在京都的夜空中远去，季节变换，洛中到了清香飘溢的新叶之季。毛球们毫不在意屁股的寒冷，开始蠢蠢欲动。
　　被天狗诱拐而获得神通力的人类美女·弁天离开了京都，苦恋着得意门生弁天并一直隐居着的大天狗·赤玉老师如意岳药师坊一边散发着寂寞与不快，一边仍旧每天在其破旧公寓中从不叠好的被褥上喝着赤玉红葡萄酒。
　　就在这个时候，赤玉老师的儿子，即在壮烈的父子吵架的最后因败北而离开的“二代目”，成为了英国绅士后，时隔百年终于归国。大惊失色。惊天动地。大吃一惊。这一震动天狗界以及狸猫界的大消息瞬间扩散到洛中内外。
　　以京都小镇为舞台，搅动人与狸猫以及天狗的想法的毛球绘卷第二集，终于开幕！

　　在忍之谷附近的一个山洞，发现不明物体似向某个地方传达讯息......另一 边在疾风流忍术学校忍风馆，馆长日向无限斋为应付五百年一次的忍术比试，开始教导众学员。突然间发生地震，结界被破坏，宇宙忍群邪神者出现并将所有疾风流学员杀光。幸好无限斋的女儿胧把残存的三名学员鹰介、七海及吼太救出，并任命他们成为传说中的继承人Hurricanger (忍风战队) 。
　　邪神者为了得到“那个”，忍风战队便阻止他们。在战斗期间出现了两名神秘战士，他们自称为轰雷者，原来是另一 派迅雷流生还的霞兄弟，但是他们憎恨疾风流并以他们为敌。为了达到邪神者同一目的，于是不断刁难忍风战士。后来他们因被利用而心心不忿，和得到鹰介三人体谅，最终两大流派一起联手对 付邪神者，并成功消灭其中一名宇宙忍者。
　　五位忍者战士受了中忍一击，生命危在旦夕，接近死亡边缘之际，绿之光弹手里剑者及时出现救活他们， 因为他的出现，不知道其身份只靠变装执行任务，他的主人就是宇宙统一忍者流的始祖觉罗。所有宇宙忍者被击败， 其后“那个”迫近，鹰介及忍者们全力去阻止地球变成黑暗世界。 经历战事过后，这班年青忍者明显成长了，忍术学校的毕业典礼顺利完成。