在美国的国际宇宙开发研究所，对开发宇宙有着无比热情的年轻研究员·冲一也自愿接受成为行星开发用改造人·代号“Super 1”的改造手术。 但是，知道Super 1存在的黑暗国家·多古马王国要求把Super 1交给他们。之后，拒绝交出Super 1的研究所被多古马派出的怪人所摧毁，存活下来的一也决心与多古马抗争到底，但现在以他自己的力量还不能变身。 一也为了学习变身的奥秘而回到日本，拜赤心寺门下，学习赤心少林拳。半年后，经过地狱般磨练的一也终于掌握了变身成Super 1的技巧，并展开了与多古马的怪人战斗。
缝在大脑上的线，俗称“记忆缝线”。 1992年爆发了病毒性脑炎疫情，全靠这项医疗技术才得以平息，而到现在，它已经进化为了日常生活不可或缺的侵入式大脑信息终端。 所见，所闻，乃至感情——在这个一切都会被记录下来的世界里，对重大犯罪案件进行调查时，需要特殊警探“电索官”来潜入记录的集合体“机忆”之中。 天才少女埃缇卡·稗田，保持着成为电索官时的最年轻记录。但她也因为这样的天赋而走到孤立。正在此时，新的搭档，金发碧眼的人型机器人“人类之友”哈罗德，出现在她面前… 在最强的二人面前，一切秘密都将无所遁形！
時ははるか未来。 NEUE（ノイエ）と呼ばれる銀河に存在する惑星セルダール。 セルダール星には別の銀河EDEN（エデン）にあるトランスバール星との友好関係の元に作られた、トランスバール市が存在する。 そこにトランスバール軍によって設立された５人の女の子による特殊部隊、それがルーンエンジェル隊である。 精鋭であるルーンエンジェル隊は紋章機と呼ばれる戦闘機を駆り、広大な宇宙を舞台に大活躍！ ……のはずだったのだが……彼女たちは一筋縄ではいかない隊員だらけだったのだ！ マイペースな５人が、気の向くままに何もなくても縦横無尽のドタバタ騒ぎを大展開！ 果たして一体どんな愉快な事件がおきるのか!? ハイテンションSFアクションコメディの決定版！
俺が必ず、お前を救ってみせる。 魔女教大罪司教「怠惰」担当ペテルギウス・ロマネコンティを打倒し、エミリアとの再開を果たしたナツキ・スバル。 辛い決別を乗り越え、ようやく和解した二人だったが、それは新たな波乱の幕開けだった。 想像を超える絶体絶命の危機、そして襲い来る無慈悲な現実。 少年は再び過酷な運命に立ち向かう。
