时为公元二二〇五年。 是以改变历史为目的的“历史修正主义者”开始对过去实施攻击的时代。 被赋予了守护历史这一使命的“审神者”，由他们所唤起的最强付丧神“刀剑男士”。 这是，他们以“某个本丸”为舞台，一心一意、开朗明快地生活的“花丸”物语——
在一个阳光明媚的日子里，左眼戴着眼罩的美少女被人搭讪，女孩则冷冷地讲述关于二重身的恐怖传说，不久果然有一个同样戴眼罩、长相与之完全相似的女孩走了过来，吓得男孩落荒而逃。原来后来者便是见崎鸣（高森奈津美 配音），恶作剧的女孩则是她自幼便分离的双胞胎姐妹未咲（五十岚裕美 配音）。性格不同的两姐妹结伴游玩，讲述着关于身世、血缘最真实的感受。令见崎担忧的是，她的左眼隐隐看到即将发生在未咲身上的不祥征兆，次日去游乐场的路上，她无论如何希望守护未咲。姐妹俩快乐而短暂的一天…… 本片根据綾辻行人的同名原作改编。
“和我一起成为漫画家吧！” 在无聊的未来，生存是一件麻烦的事——这样无所事事地过着每一天的中学生真城最高，在某一天，被同班的年级顶尖秀才高木秋人叫住。“一直以来成为漫画家是我的梦想，只要富有文采的自己和拥有优秀绘画才能的最高一起搭档就能实现梦想”，秋人热血沸腾地如是说。 最高却果断拒绝了邀请。3年前，目睹了自己最喜欢的职业漫画家的叔父死去的最高，从那时起就放弃了成为叔父那样的漫画家。 可是在那天晚上，最高接到秋人的电话之后，拜访自己憧憬的美少女亚豆美保的家。之后看到秋人了不得的“告白”和亚豆了不得的“回答”，头脑发热的最高向亚豆提出了“两人的漫画动画化了的话”就与他结婚的申请！！ 为了履行与亚豆的约定，最高决意与秋人共同迈向成为职业漫画家的艰难道路。之前完全新手的两人，从漫画的创作到编辑部的申请，然后目标连载，以热情将青春的一切赌在漫画上！ 最高和秋人是否能成为职业漫画家来连载作品？最高和亚豆是否能迎来圆满结局！？实现少年梦想的超现实青春故事，现在开始了！
某日，正在上高中的巳真兔季子（KEY）突然接到了和自己相依为命的爷爷的死讯，但她却哭不出来，因为她是个“机器人”，一个由爷爷亲手创造的完美的“机器人”，也正是由于这一点她从小就一直受到周围同龄人的讥笑和嘲讽。爷爷死前给KEY留下了口信，“去吧，孩子，你不用再作为一个机器人活着，去成为一个真正的人......但有个条件，你必需要有朋友，真正的朋友，能全心全意为你哭、为你笑的人，人数大约需要三万人。” 抱着这样一个几乎不可能实现的愿望，KEY只身来到东京。在这里她遇到了以前国中的朋友厨川樱，以及偶像歌星美浦的歌迷会会长三和土州一，大家一起为实现KEY的愿望，将她发展成偶像歌手而努力着。同时爷爷的助手若木知叶也悄悄来到了东京，似乎预示着KEY身边会发生不寻常的事。另一方面，偶像歌星美浦及其所属的米诺斯公司也并非看上去的那么简单，到底它的后台老板蛙杖有什么不可告人的目的？他与KEY爷爷的死有关吗？KEY的身体里到底有什么秘密？她最后能如愿地成为偶像，变成一个普通的女孩吗？
一个神秘的名叫珠露露（ジュルル）的婴儿突然出现在少女们身边，最先发现她的真中啦啦因为各种原因自然而然地成为了她的母亲，暂时照顾她，升级为“妈妈”。此外，新系列中还将出现一个神秘三人偶像组合。分别是珠音，花音，日音。
在19世纪末与海盗船一同沉入新加坡近海的、世界上最大的蓝宝石“绀青之拳”。在当地的富豪将其回收，于舞台上展现其真容时，在滨海湾金沙酒店附近发生了杀人案。现场留下了怪盗基德沾有血迹的预告函。而在那时，为了观看在新加坡举办的空手道锦标赛，小兰和园子到访了当地。 由于没有护照所以无法出国的柯南本来应当在看家，但他被试图利用他的基德以魔术般的方法，强行带到了新加坡。若不服从对方就连回日本都做不到的柯南，眼镜、手表、衣服等全被夺走进行了变装。被没有注意到其真实身份的小兰问及名字，情急之下化名“亚瑟·平井”。 基德得到了在某个宅邸的地下金库中沉睡着蓝宝石的情报。他以为很简单就可入侵成功，但无比危险的陷阱等待着基德。挡在他面前的，是400战无败绩的最强空手道家——京极真。基德的命运是……在那之后，就如预兆着什么不祥之事一般，从新加坡的象征——鱼尾狮中喷出了被染为鲜红的水！
