喜羊羊与灰太狼意外被带到了未来世界，为了回到自己的时空，二人与未来的小羊们收集分散的象星石碎片。但过程中，一神秘反派也派遣厉害的手下来抢夺碎片，于是双方势力开展了精彩纷呈的碎片争夺战。
元初城游神卫？天妖门？灭妖会？煞？ 东宁府大战之后，孟川上元初山之前，谜题能否揭晓——
基因石被毁，不料基因石能量逸出，飘散到地球各处，引发了异常现象，故事从变形机甲、机甲兽和变异战士三方之间的斗争展开。
黑魔王从星际监狱逃脱了！他魔王重获自由的第一件事，就是直捣星际判官的家，报当年被判入狱之仇，星猫眼睁睁地看着父母在战斗中，掉进无垠的银河深处。为了拯救父母，惩罚黑魔王，星猫决定跟好友小卷，一路尾随黑魔王的足迹来到了地球。
