《星学院Ⅲ之潘朵拉秘境》是“星学院”系列的第三部，主要讲述了菲洛、小月、美星三位魔法少女进入潘朵拉奇幻社就职的故事：菲洛和伙伴们通过在星学院的学习，成长为优秀的魔法师，并且即将面临毕业考核。然而这时，她们意外被卷入一场魔卡精灵的失踪事件。与此同时，瑞拉国王突然病重、潘朵拉魔卡风靡一时、王国大臣神秘消失，一切事件的背后似乎埋藏着十年前的一个惊天秘密。为了查明真相，菲洛和伙伴们加入潘朵拉奇幻社，成为极光组的一员。
主角柯奇是一个真诚善良，但性格有些冲动的玩具机器人。在危急时刻，他遇到了另一群玩具——聪慧的黑包子、沉稳的刀剑客、热心的小骨头、勇敢的点点、机智的嗦发。在他们共同帮助下，柯奇很快融入了友爱的玩具之家。好景不长，玩具之家被老鼠皮条破坏，大家不知该何去何从。这时，黑包子告诉大家，玩具城城主托雷能为玩具们实现任何愿望。于是众人决定结伴前往托雷玩具城。
李鸣洋原本是一名平凡上班族，因为一个奇怪的二维码而陷入一个杀戮都市。在这里所有人都被迫参与到一场追杀与被杀的生存游戏中。在找寻逃出这个城市的出路过程中，整个事件的幕后黑手也一步步浮出水面。
斗魂大赛开始了，立志要振兴唐门的霍雨浩等人代表唐门参赛，赛前唐门大师兄贝贝意外被魔化的恋人小雅打伤，霍雨浩不得不担任唐门的临时指挥人，在霍雨浩的安排下，唐门一路披荆斩棘，战无不胜。可在八强赛中，霍雨浩率领的唐门却对上了王秋儿带领的史莱克学院。
五千年前，对于修行有着无数憧憬的少年，却因体质特殊而无法突破炼体期，进入下一个修炼境界。他从远古神话时代一直修炼到了现代社会，站在繁华都市中，炼体期九万九千四百四十二层的轩辕铭。给自己定了一个小目标：先修炼到炼体期十万层！
2048年，超级反派凌辰（化名潘洛斯）在和死对头超级英雄叶子暮的激战中意外穿越回2030年的高二。在回家见到姨母确定了自己穿越的事实后，凌辰决定，这次一定要守护好上一世因叶子暮害死的姨母，除掉叶子暮。”重生“的时间线充满变数，这次，凌辰相信自己可以改变一切！
