故事舞台是在机动战士高达中的一年战争终结后七年。战争结束后一部份吉恩公国军事势力并未降伏继续在各地与地球联邦军发生军事冲突，因此地球联邦军内部强力主张追杀吉恩残余份子的激进排他势力泰坦斯（Titans）结成。由于泰坦斯对宇宙住民的强硬血腥镇压的手段，反势力奥干A.E.U.G.(台湾翻译为奥干，港译为奥古)结成。故事的开始于宇宙世纪0087年（U.C. 0087），前半主要围绕奥干和泰坦斯两派系的对抗，中段吉恩残余份子上阿克西斯(港译为阿古捷斯)登场，与奥干、泰坦斯角力周周旋，展开激战。
2012年日蚀的一天进行名为“魔宴（Shabbat）”仪式，从而诞生出魔物“魅影（Phantom）”肆虐。 本作主角操真晴人在此仪式中生还，如谜一般的白色魔法使把变身系统Wizard Driver交付给他并变身成为假面骑士Wizard。 从此踏入守护人类及与魔物战斗的命运。
因过去的心理阴影而以独自的别扭思考回路讴歌着“独自生活”的比企谷八幡，由于意外的事件而被生活指导担当教师平冢静带去“侍奉部”并加入其中。他和同社团所属的令人窒息的完美美少女·雪之下雪乃，以及班级上位阶级所属的时髦女子·由比滨结衣一同，从解决班上的人际关系问题到文化祭实行委员的运营，度过着解决各种案件的每一天。 时至秋日，八幡等二年级学生前去修学旅行。此时，侍奉部接收到了一个委托。 随着新登场的一色彩羽的加入，他们的关系更加错综复杂。 ——八幡空虚的价值观也有了少许变化，在这些经验过后，他的高中生活又将迎来新的展开。
被卷入飞机事故的七名高中生。 他们醒来之后，发现自己身处魔法与兽人存在的异世界。 在没有电力的世界中建造核电站，仅仅是外出赚钱就能控制大都市的经济， 为了帮助为苛政所苦的恩人们而与无良贵族开战，简直为所欲为？! 不错，他们所有人都并非是普通的高中生， 而是各自立于政治、经济、科学、医疗界顶点的超人高中生！ 这是拥有地球上最高的睿智与技术的梦之队所带来的， 毫不保留地运用超高技术的异世界革命物语！
这位穿黄黑横纹背心、传统日式木屐的小男孩，以头发、背心和木屐当武器，和一群住在神秘森林里的妖怪朋友们，一起解决妖怪与人类两个世界的许多问题。作为幽灵族最后幸存者的少年“鬼太郎”，施展妖术，和干尽各种坏事的妖怪们作战。
