《果宝特攻3》讲述了 菠萝吹雪 偶然间穿越到了 古代 的水果世界。古代水果尚未经过培植改良，都是野果， 菠萝吹雪 从他们身上学习到中华兵法及古代书画，立志成为为民除害的 英雄 。 菠萝吹雪 开始修复时光机的 旅程 ，竟然遇到了水果伙伴们的 祖先 ，最后帮助他们打败了 火龙果 ，并顺利回到 现代 。
莫凡迁至魔都，卷入“秘密事件”的调查中。过程中，莫凡帮助唐月脱困，意外获得玫炎火种，再度觉醒双系，目标直指明珠学府。大学生活开始，召唤系迎来“斗兽大赛”的挑战。
战国末年，内忧外患的韩国，发生了一件离奇诡谲的案件，军饷神秘消失，鬼影重重，涉案之人先后死于非命。 韩非、张良、卫庄，这三个拥有绝世之才的人，命运交织在了一起，面对重重迷雾，他们赫然发现韩国的未来危如累卵。 那紫雾背后的冷峻眼神，已看出这棋局的胜负了吗？
赵祁重生到了战国时期。正值于秦始皇嬴政开启扫六合，统天下之时。毅然入伍从军，没想到竟然开启杀敌升级系统！赵祁一步步成为了大秦锐士的统帅，当看到秦始皇后，顿时惊了，自己竟然是始皇之子，大秦长公子！
王胜于现代世界醒来，曾与之相伴的人依稀仍在左右，这究竟是一场梦，还是另一场天大的阴谋？
明日岛虽然鼓励创新，但新技术存在着很高的风险，同时明日岛也面临着很多自然灾害。面对各种危机，由代表科学（S）的赛拉斯、技术（T）的甜甜、工程（E）的爱迪、艺术（A）的阿力、数学（M）的曼妮莎和运动（！）的小金组成的超学先锋就会挺身而出，赶往救援的第一线。在塞拉斯的指挥下，队员们分工合作，利用各种科学知识解决各种麻烦。在处理危机的过程中，队员们可能会产生观点和行动上的分歧，但最后大家总能坚持团结合作精神，并找到解决问题的最佳方案。而人工智能百变校巴作为超学先锋的重要成员，也会变身各种工程车，助力救援行动。
兽王争锋冠军争霸赛，只有获得兽王争锋冠军的战队才有资格参加的最高级别赛事，崭新的舞台，全新的规则，新奇的精灵，以及未知的神秘力量——原石之力。在资格赛中获得参赛资格的GOGO战队，将挑战这个全新的赛事，并立志获得冠军争霸赛的第一名，成为名副其实的最强战队。随着比赛的进行，对新规则和新精灵一无所知的GOGO战队，渐渐掌握了规则，提升了各自的能力，越战越勇，并为此四处寻找神秘的原石，战胜了一支又一支冠军战队。同时，参加比赛的战队中有一支面具战队，他们的实力极强，手段凶残，始终给泰羽一种不舒服又熟悉的感觉，当泰羽发现面具战队的天劫正在利用全新的混世精灵收集黑暗力量，并企图用黑暗力量统治地球时，泰羽以及GOGO战队决定不惜一切代价阻止他。更令人意外的是，这个天劫的真面目竟然是坠入岩浆的镐天，不仅如此，他还带着魔焱残留的力量，准备再次卷土重来，让混沌力量及黑暗吞噬这个世界。为了荣誉，更为了世界的和平，泰羽和GOGO战队再次肩负重任，站在了拥有无限力量的混沌巨神镐天的面前。
期末考结束后，零班成员除古月外在舞长空的提议下加入了唐门。回到东海城，零班加入新成员许小言，正式成立了以唐舞麟为首的四人团队。为了即将到来的天海联盟大比，舞长空对零班学员进行恶魔特训，正式开赛后，零班一路在个人赛和团体赛披荆斩棘，但在和双胞胎对战的过程中，唐舞麟古月深受重伤，零班不得不中途退赛。蛰伏三年后，零班学员在舞长空的带领下踏上前往史莱克学员的路程。
在星星球20903年，嚯哈哈回来协助大大怪和小小怪侵略星星球，嚯哈哈学到一个强大的魔法，这个魔法能让星星球日常生活物件的重要部件消失，从而让这个物品不能使用，由此星星球很多东西的重要部件消失，给人们的生活造成了诸多不便，甚至引发了大混乱，为了让人们的生活恢置正常，宅博士带领以开心超人为首的超人们找到了失踪的重要部件，并重新期作出来。在此过程中，超人们知道了生活中一些日常东西运作背后蕴藏的科学道理，再次挫败了大大怪和小小怪的阴谋
